More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2037 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  100 
 
 		 335 aa  646    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  91.04 
 
 		 335 aa  548  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  67.09 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  66.77 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  66.77 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  53.56 
 
 		 317 aa  305  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  52.92 
 
 		 317 aa  299  4e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  52.92 
 
 		 317 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  53.36 
 
 		 335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  53.66 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  45.21 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  44.48 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  43.9 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  48.03 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  47.16 
 
 		 331 aa  232  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  40.67 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  40.88 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  45.39 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  48.48 
 
 		 316 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  47.74 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  41.67 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  45.35 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  47.02 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  45.08 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  45.98 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  45.9 
 
 		 346 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  39.03 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  39.03 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  43.94 
 
 		 355 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  39.03 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  39.03 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 		 354 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  39.03 
 
 		 354 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  38.04 
 
 		 354 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  38.57 
 
 		 333 aa  205  9e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  43.55 
 
 		 356 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  38.27 
 
 		 352 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  35.71 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  38.57 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  45.48 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  39.52 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  41.2 
 
 		 362 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  39.07 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  38.7 
 
 		 354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  37.55 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  39.3 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  42.81 
 
 		 314 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  36.84 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  37.42 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  35.37 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  38.77 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  38.77 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  30.95 
 
 		 317 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  35.5 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  35.18 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  35.79 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  24.78 
 
 		 362 aa  72.8  0.000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  28.02 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  26.3 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  29.96 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3222  transport system permease protein  27.8 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118278 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  29.52 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2812  iron-hydroxamate transporter permease subunit  29.91 
 
 		 672 aa  66.2  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  27.85 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  27.85 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  27.85 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5231  transport system permease protein  33.8 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  24.32 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0834  ABC transporter permease  29.31 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  25.59 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  30.17 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  24.03 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  29.74 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1284  transport system permease protein  27.6 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.348049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  27.78 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  26.35 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0779  iron compound ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100059  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  26.35 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0704  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.9 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3497  transport system permease protein  42.67 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.141787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  25.66 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0688  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.9 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.690213 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0750  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.9 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  24.73 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0631  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.9 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0645  iron-enterobactin transporter membrane protein  28.9 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.997729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  26.79 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  31.61 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.05 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2756  transport system permease protein  29.7 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.987202  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  26.48 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>