100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1922 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  100 
 
 		 392 aa  783    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  96.16 
 
 		 392 aa  738    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  79.8 
 
 		 393 aa  648    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  81.96 
 
 		 392 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  74.17 
 
 		 409 aa  611  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  74.1 
 
 		 393 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  72.56 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  72.56 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  72.56 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  72.56 
 
 		 393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  72.56 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  72.56 
 
 		 393 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  72.31 
 
 		 393 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  73.33 
 
 		 393 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  72.31 
 
 		 393 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  72.31 
 
 		 393 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  73.33 
 
 		 393 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  73.33 
 
 		 393 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  73.33 
 
 		 393 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  73.08 
 
 		 393 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  62.44 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  62.44 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  62.44 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  62.44 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  62.44 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  62.44 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  62.18 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  62.21 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  52.19 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  53.87 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  53.61 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  52.19 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  53.35 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  53.09 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  53.35 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  52.19 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  53.09 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  52.96 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  54.2 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  50.56 
 
 		 381 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  47.94 
 
 		 360 aa  346  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  38.14 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  36.14 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  33.83 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  37.74 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.87 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 444 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  28.84 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  41.3 
 
 		 160 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  23.8 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.06 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 403 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  23.26 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 403 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  34.41 
 
 		 428 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  23.31 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.21 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  21.82 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  26 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  25.48 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  27.39 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  28.8 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  27 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  20.59 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  24.43 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 383 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1015  major facilitator transporter  38.37 
 
 		 498 aa  43.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.817522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>