More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1801 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  100 
 
 
267 aa  547  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  92.51 
 
 
267 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  54.3 
 
 
283 aa  268  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.78 
 
 
274 aa  265  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.84 
 
 
253 aa  259  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.4 
 
 
251 aa  259  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50.58 
 
 
264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  48.64 
 
 
271 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.72 
 
 
264 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  50.8 
 
 
261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 
259 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.59 
 
 
259 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.88 
 
 
291 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  50.4 
 
 
259 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  51.77 
 
 
254 aa  248  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  52.12 
 
 
257 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.21 
 
 
253 aa  248  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.67 
 
 
286 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  46.67 
 
 
286 aa  248  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.43 
 
 
261 aa  247  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  51.42 
 
 
263 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  52.46 
 
 
293 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  52.46 
 
 
293 aa  247  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.83 
 
 
265 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50.41 
 
 
304 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  51.67 
 
 
303 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  51.67 
 
 
303 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  51.67 
 
 
303 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.6 
 
 
279 aa  246  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.88 
 
 
273 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.41 
 
 
304 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  49.61 
 
 
259 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
308 aa  245  6e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 
259 aa  244  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.23 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.61 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.9 
 
 
267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.03 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  49.41 
 
 
258 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  46.62 
 
 
276 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50 
 
 
282 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.98 
 
 
263 aa  239  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 
271 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.21 
 
 
260 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.79 
 
 
265 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  49 
 
 
263 aa  239  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  46.54 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.59 
 
 
257 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  50.8 
 
 
283 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.88 
 
 
260 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.79 
 
 
259 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  50 
 
 
301 aa  237  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  45.56 
 
 
292 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
261 aa  238  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.63 
 
 
260 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.83 
 
 
258 aa  236  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.12 
 
 
256 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.43 
 
 
267 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
260 aa  236  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.27 
 
 
264 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.56 
 
 
280 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  47.93 
 
 
303 aa  235  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.83 
 
 
285 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  47.83 
 
 
285 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  49.03 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  49.03 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
264 aa  234  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  47.93 
 
 
306 aa  234  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  52.99 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  49.36 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.81 
 
 
265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  50 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.62 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  48.35 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  47.77 
 
 
275 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.72 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  49.61 
 
 
265 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  49.61 
 
 
265 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  49.61 
 
 
265 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.74 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 
251 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.32 
 
 
254 aa  232  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  49.21 
 
 
265 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  52.38 
 
 
262 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.81 
 
 
278 aa  231  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.09 
 
 
272 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.48 
 
 
276 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.05 
 
 
279 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.37 
 
 
259 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  49 
 
 
277 aa  230  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.06 
 
 
254 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>