More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1792 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 317 aa  655    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  96.53 
 
 		 317 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2705  transcriptional regulator CysB-like protein  81.7 
 
 		 317 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2917  transcriptional regulator CysB-like protein  82.02 
 
 		 317 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1289  transcriptional regulator CysB-like protein  78.55 
 
 		 317 aa  508  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  69.72 
 
 		 316 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000101541  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  69.4 
 
 		 316 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000765107  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  69.09 
 
 		 316 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000889139  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  68.77 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  68.77 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2110  transcriptional regulator Cbl  69.09 
 
 		 316 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.3178700000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  68.77 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  69.09 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142733  hitchhiker  0.0000552963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  69.09 
 
 		 316 aa  448  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2563  transcriptional regulator Cbl  69.72 
 
 		 316 aa  434  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00294474  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  56.91 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 308 aa  363  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  55.59 
 
 		 314 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  55.81 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  54.33 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  54.33 
 
 		 308 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  54.33 
 
 		 308 aa  351  8e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  54.33 
 
 		 308 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  53.67 
 
 		 308 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  348  7e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  53.33 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  53.33 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  52.3 
 
 		 308 aa  341  9e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  52.61 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  53.04 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  52.61 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  51.96 
 
 		 327 aa  335  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  53.16 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 354 aa  331  8e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  51.99 
 
 		 312 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 311 aa  322  6e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  48.97 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  48.28 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  53.29 
 
 		 314 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  45.95 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  44.98 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  47.3 
 
 		 313 aa  288  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  45.81 
 
 		 313 aa  288  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  45.27 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  45.27 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  45.27 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  45.27 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  44.98 
 
 		 313 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  47.24 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  44.69 
 
 		 333 aa  285  8e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  51.21 
 
 		 314 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  44.93 
 
 		 313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  44.93 
 
 		 313 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  44.59 
 
 		 313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  46.51 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  44.37 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  46.21 
 
 		 312 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  45.95 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  44.05 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  46.51 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  44.26 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  43.92 
 
 		 313 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  46.28 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  47.3 
 
 		 306 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  43.24 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  43.24 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  43.58 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  45.16 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  46.69 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  43.89 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  43.63 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  43.89 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  44.73 
 
 		 317 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2599  transcriptional regulator CysB-like protein  45.33 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.174943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  43.91 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  45.33 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  43.27 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  45.67 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  43.59 
 
 		 324 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  42.95 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  42.95 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  42.95 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  44.77 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>