284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1768 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  63.54 
 
 
1024 aa  1356    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  63.93 
 
 
1024 aa  1343    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  38.02 
 
 
1033 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  63.93 
 
 
1024 aa  1343    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  68.23 
 
 
1032 aa  1459    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  49.09 
 
 
1041 aa  1009    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  63.66 
 
 
1066 aa  1427    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  63.73 
 
 
1024 aa  1339    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  63.44 
 
 
1024 aa  1328    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  36.44 
 
 
1019 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  52.28 
 
 
1031 aa  1104    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  49.57 
 
 
1036 aa  1025    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  50.87 
 
 
1035 aa  1055    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  100 
 
 
1043 aa  2166    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  38.02 
 
 
1164 aa  669    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  62.34 
 
 
1028 aa  1343    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  64.24 
 
 
1050 aa  1427    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  63.93 
 
 
1024 aa  1343    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  51.99 
 
 
1044 aa  1041    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  89.17 
 
 
1043 aa  1912    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  69.17 
 
 
1036 aa  1470    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  63.76 
 
 
1066 aa  1428    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  64.03 
 
 
1024 aa  1345    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  64.13 
 
 
1024 aa  1347    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  69.43 
 
 
1029 aa  1509    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  36.16 
 
 
1084 aa  629  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  36.41 
 
 
1084 aa  626  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.66 
 
 
1026 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  35.28 
 
 
1049 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 
1079 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  34.34 
 
 
1043 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  35.26 
 
 
1063 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  34.38 
 
 
1455 aa  600  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  37.25 
 
 
1094 aa  595  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  37.61 
 
 
1020 aa  595  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  35.43 
 
 
1129 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  36.4 
 
 
1076 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  37.37 
 
 
1043 aa  580  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  34.15 
 
 
1024 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  32.85 
 
 
1108 aa  579  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.62 
 
 
1041 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.59 
 
 
1033 aa  569  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  35.01 
 
 
1045 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  32.29 
 
 
1046 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  33.71 
 
 
1045 aa  559  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  34.53 
 
 
1059 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  35.43 
 
 
1030 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
1077 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  35 
 
 
1003 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.04 
 
 
1013 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.94 
 
 
1030 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  32.61 
 
 
1032 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  33.83 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  32.64 
 
 
1030 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.64 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  32.64 
 
 
1030 aa  531  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.64 
 
 
1030 aa  531  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.74 
 
 
1030 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.64 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  32.64 
 
 
1030 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.71 
 
 
1030 aa  525  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.39 
 
 
1018 aa  525  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  33.43 
 
 
1035 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  30.64 
 
 
1009 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.54 
 
 
1012 aa  501  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  35.12 
 
 
1023 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  33 
 
 
1112 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.71 
 
 
992 aa  492  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  32.22 
 
 
1008 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.46 
 
 
1264 aa  488  1e-136  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.63 
 
 
1289 aa  484  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 
1020 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.97 
 
 
1003 aa  479  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.44 
 
 
1004 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  30.98 
 
 
1026 aa  476  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  34.33 
 
 
1012 aa  471  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  35.68 
 
 
968 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.3 
 
 
1036 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.87 
 
 
1053 aa  459  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  34.45 
 
 
992 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 
1017 aa  436  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.67 
 
 
1005 aa  435  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  32.43 
 
 
1021 aa  430  1e-119  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  30.61 
 
 
1329 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  31.13 
 
 
1023 aa  420  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.12 
 
 
996 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  29.93 
 
 
1017 aa  382  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 
1022 aa  369  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  34.77 
 
 
640 aa  366  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 
628 aa  343  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.09 
 
 
1424 aa  337  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  42.16 
 
 
349 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.87 
 
 
1600 aa  272  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.25 
 
 
920 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  25.21 
 
 
987 aa  161  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.41 
 
 
920 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46582  predicted protein  25.23 
 
 
561 aa  145  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  25.59 
 
 
972 aa  142  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  24.24 
 
 
951 aa  141  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.05 
 
 
811 aa  131  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>