144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1762 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  100 
 
 		 592 aa  1218    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  74.22 
 
 		 456 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  74.22 
 
 		 456 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  33.91 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  34.67 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  34 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  60 
 
 		 461 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  55.96 
 
 		 2732 aa  123  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  57.84 
 
 		 540 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  55.88 
 
 		 101 aa  100  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  54 
 
 		 100 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  51.58 
 
 		 466 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5275  hypothetical protein  40.37 
 
 		 115 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  53.76 
 
 		 96 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  50.52 
 
 		 169 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  53.66 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  48.11 
 
 		 176 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0116  putative S-type colicin  29.59 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.305649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1944  hypothetical protein  35.78 
 
 		 110 aa  77  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  48.39 
 
 		 94 aa  77  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  48.24 
 
 		 88 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4364  hypothetical protein  37.61 
 
 		 109 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4426  hypothetical protein  37.61 
 
 		 109 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.207049 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  50.51 
 
 		 88 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  44.58 
 
 		 94 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  46.91 
 
 		 88 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  46.59 
 
 		 855 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  42.42 
 
 		 96 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2916  hypothetical protein  35.24 
 
 		 129 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  43.88 
 
 		 96 aa  61.6  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  46.15 
 
 		 1379 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  35 
 
 		 1229 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  40.96 
 
 		 1446 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  45.36 
 
 		 87 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  45.36 
 
 		 87 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  39.78 
 
 		 99 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  46.84 
 
 		 96 aa  60.1  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  45.36 
 
 		 87 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  43.59 
 
 		 1421 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  46.15 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00543  hypothetical protein  29.23 
 
 		 859 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  38.14 
 
 		 113 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  46.91 
 
 		 172 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3156  PAAR repeat-containing protein  43.81 
 
 		 96 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  43.21 
 
 		 118 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  41.86 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  41.94 
 
 		 1385 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1400 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  46.51 
 
 		 185 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  37.98 
 
 		 406 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  41.94 
 
 		 1409 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1867  hypothetical protein  44.32 
 
 		 107 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  40.24 
 
 		 1422 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  44.71 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0240  PAAR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 113 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5373  hypothetical protein  32.29 
 
 		 113 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  44.83 
 
 		 174 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  32.52 
 
 		 1475 aa  55.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4114  PAAR repeat-containing protein  42.06 
 
 		 96 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.916002  hitchhiker  0.00152888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3608  PAAR  41.41 
 
 		 92 aa  55.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  32.41 
 
 		 1457 aa  54.7  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  44.59 
 
 		 1140 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  43.04 
 
 		 1386 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  43.53 
 
 		 434 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  39.74 
 
 		 1359 aa  54.3  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4540  hypothetical protein  29.79 
 
 		 163 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.878379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0368  PAAR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 100 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  32.5 
 
 		 1428 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0258  hypothetical protein  32.35 
 
 		 123 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  32.41 
 
 		 1447 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  34.58 
 
 		 1527 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  39.24 
 
 		 86 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  36.71 
 
 		 1423 aa  52  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  38.74 
 
 		 102 aa  51.6  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  38.04 
 
 		 1410 aa  51.6  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1375  hypothetical protein  37 
 
 		 86 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  37.8 
 
 		 1419 aa  51.2  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1933  hypothetical protein  37 
 
 		 86 aa  50.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.437676  normal  0.622076 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1487  hypothetical protein  37 
 
 		 86 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3584  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 84 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0685  PAAR  36.11 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  37.04 
 
 		 1494 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1494 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  37.5 
 
 		 1437 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3017  PAAR repeat-containing protein  41.03 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.501568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1487 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  42.5 
 
 		 179 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0895  hypothetical protein  39 
 
 		 89 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.457574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1039  PAAR  39 
 
 		 89 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  38.46 
 
 		 481 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2461  hypothetical protein  36.94 
 
 		 99 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  41.77 
 
 		 1411 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  40.21 
 
 		 88 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  34.21 
 
 		 102 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3002  PAAR  37.84 
 
 		 99 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5249  PAAR repeat-containing protein  39.81 
 
 		 96 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000530651 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  36.25 
 
 		 1517 aa  48.5  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  56.41 
 
 		 1505 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>