More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1736 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
318 aa  641    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  57.59 
 
 
684 aa  291  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  51.36 
 
 
831 aa  267  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  51.5 
 
 
1402 aa  257  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  50 
 
 
789 aa  251  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  48.84 
 
 
489 aa  249  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  51.16 
 
 
961 aa  247  1e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  49.41 
 
 
341 aa  246  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  48.48 
 
 
305 aa  242  5e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  48.45 
 
 
557 aa  241  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  45.21 
 
 
425 aa  241  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  52.19 
 
 
1493 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  46.9 
 
 
393 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  46.88 
 
 
1037 aa  236  5.0000000000000005e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.75 
 
 
528 aa  232  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  47.49 
 
 
685 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  48.85 
 
 
490 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  45.77 
 
 
490 aa  227  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  49.39 
 
 
448 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  45.28 
 
 
416 aa  225  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.28 
 
 
343 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  47.71 
 
 
838 aa  203  2e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  49.34 
 
 
267 aa  203  4e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.61 
 
 
380 aa  203  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  55.43 
 
 
232 aa  202  8e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  41.67 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  49.09 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  46.54 
 
 
235 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  50 
 
 
2413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  40.46 
 
 
376 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  40.6 
 
 
376 aa  199  7e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  43.28 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  43.51 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  41.42 
 
 
1002 aa  195  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  45.93 
 
 
256 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  40.47 
 
 
380 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.91 
 
 
1877 aa  193  3e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  44.84 
 
 
464 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.95 
 
 
278 aa  192  9e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  42.54 
 
 
373 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  44.93 
 
 
271 aa  189  4e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 
380 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 
392 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.13 
 
 
346 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 
1032 aa  187  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  48.36 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  41.09 
 
 
976 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  39.18 
 
 
255 aa  179  8e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  43.75 
 
 
552 aa  178  1e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  40.38 
 
 
331 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.45 
 
 
509 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.45 
 
 
509 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.45 
 
 
509 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.45 
 
 
509 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  37.9 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  48.89 
 
 
208 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  31.15 
 
 
399 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  42.28 
 
 
325 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.68 
 
 
282 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.06 
 
 
865 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  47.51 
 
 
731 aa  169  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  41.46 
 
 
325 aa  169  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.46 
 
 
325 aa  169  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  44.44 
 
 
316 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  37.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  37.5 
 
 
331 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  35.4 
 
 
1430 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  37.26 
 
 
331 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40.56 
 
 
254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  54.32 
 
 
185 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.33 
 
 
523 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  40.31 
 
 
315 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  39.62 
 
 
285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  37.55 
 
 
680 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  45.26 
 
 
763 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  40.24 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  38.05 
 
 
482 aa  162  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  41.2 
 
 
839 aa  162  9e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  35.06 
 
 
679 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  42.03 
 
 
245 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  35.77 
 
 
303 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 
1910 aa  159  8e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40.14 
 
 
301 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  33.92 
 
 
359 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  49.43 
 
 
304 aa  152  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  45.1 
 
 
274 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  36.15 
 
 
365 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  34.62 
 
 
850 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.15 
 
 
321 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.69 
 
 
321 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1283  enhanced entry protein EnhC  38.06 
 
 
1044 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.216274  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1234  enhanced entry protein enhC, tetratricopeptide repeat family  38.06 
 
 
1078 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.155783  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  35.58 
 
 
1141 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  45.34 
 
 
241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.12 
 
 
358 aa  144  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  36.82 
 
 
765 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.22 
 
 
512 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  49.66 
 
 
193 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.96 
 
 
272 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>