29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1663 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  91.4 
 
 		 186 aa  351  4e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  71.2 
 
 		 186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  69.57 
 
 		 186 aa  280  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  70.65 
 
 		 186 aa  280  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  70.11 
 
 		 186 aa  278  2e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  69.02 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  274  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  67.93 
 
 		 186 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  66.85 
 
 		 186 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  66.85 
 
 		 186 aa  270  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  65.76 
 
 		 186 aa  268  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  64.67 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  38.95 
 
 		 245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  37.23 
 
 		 255 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  36.7 
 
 		 251 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  37.57 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  36.99 
 
 		 183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  36.99 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  29.94 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  28.42 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  27.01 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  29.71 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  28.95 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  28.73 
 
 		 209 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  25.57 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  29.14 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  25.57 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  27.87 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>