28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1482 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1482  protein of unknown function DUF817  100 
 
 
286 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000581857  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6238  hypothetical protein  69.92 
 
 
271 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1038  protein of unknown function DUF817  49.8 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3475  hypothetical protein  48.41 
 
 
254 aa  228  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3188  hypothetical protein  48.02 
 
 
254 aa  228  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.175856  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1773  hypothetical protein  48.02 
 
 
254 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000100092  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3191  hypothetical protein  47.81 
 
 
254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000002429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3505  hypothetical protein  46.99 
 
 
254 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3278  hypothetical protein  46.22 
 
 
254 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000124839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3492  hypothetical protein  46.22 
 
 
254 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3248  hypothetical protein  46.22 
 
 
254 aa  221  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000202947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3535  hypothetical protein  46.22 
 
 
254 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3488  hypothetical protein  47.84 
 
 
254 aa  221  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000482446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1356  hypothetical protein  41.85 
 
 
294 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1728  hypothetical protein  42.63 
 
 
265 aa  205  7e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.718343  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5263  protein of unknown function DUF817  45.2 
 
 
309 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4796  hypothetical protein  45.2 
 
 
309 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  0.526539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2636  hypothetical protein  40.81 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5339  protein of unknown function DUF817  43.25 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.930782  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3287  protein of unknown function DUF817  41.39 
 
 
305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3567  hypothetical protein  42.18 
 
 
305 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1644  hypothetical protein  41.01 
 
 
285 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3105  hypothetical protein  43.65 
 
 
324 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.245287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6773  hypothetical protein  43.36 
 
 
298 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.277117  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1584  hypothetical protein  38.02 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1090  hypothetical protein  37.55 
 
 
281 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0258081 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0407  hypothetical protein  38.72 
 
 
259 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0304882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0117  hypothetical protein  40.96 
 
 
452 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.208419  normal  0.368342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>