More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1412 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  55.09 
 
 		 650 aa  668    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  53.77 
 
 		 660 aa  639    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  95.94 
 
 		 640 aa  1205    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  54.92 
 
 		 654 aa  667    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  71.16 
 
 		 655 aa  914    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  54.92 
 
 		 654 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 640 aa  1300    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  49.69 
 
 		 675 aa  622  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  52.51 
 
 		 662 aa  617  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  50.73 
 
 		 658 aa  611  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  48.75 
 
 		 714 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  50.56 
 
 		 704 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  51.06 
 
 		 672 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  50.89 
 
 		 724 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  51.18 
 
 		 707 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  50.16 
 
 		 705 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  50.32 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  50.32 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  51.29 
 
 		 710 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  50 
 
 		 702 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  49.84 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  49.41 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  49.41 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  49.84 
 
 		 705 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  49.41 
 
 		 640 aa  601  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  49.84 
 
 		 706 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  51.28 
 
 		 710 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  50.73 
 
 		 674 aa  596  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  49.68 
 
 		 703 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  49.59 
 
 		 697 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  49.27 
 
 		 705 aa  588  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  49.69 
 
 		 703 aa  589  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  47.99 
 
 		 689 aa  581  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  48.68 
 
 		 681 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  45.81 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  45.81 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  45.81 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  72.5 
 
 		 716 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  45.48 
 
 		 686 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  73.58 
 
 		 714 aa  525  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  45.65 
 
 		 686 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  37.8 
 
 		 696 aa  412  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  40.07 
 
 		 655 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  36.62 
 
 		 673 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  36.29 
 
 		 670 aa  356  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  34.49 
 
 		 666 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  35.23 
 
 		 658 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  34.47 
 
 		 645 aa  316  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  35.29 
 
 		 658 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  34.53 
 
 		 650 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  35.31 
 
 		 703 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  38.93 
 
 		 725 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  34.52 
 
 		 776 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  36.46 
 
 		 748 aa  310  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2027  general secretion pathway protein D  34.68 
 
 		 649 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  35.32 
 
 		 650 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  33.9 
 
 		 758 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  34.8 
 
 		 634 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  31.78 
 
 		 791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  31.63 
 
 		 791 aa  273  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  30.56 
 
 		 682 aa  267  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  30.82 
 
 		 787 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  31.67 
 
 		 717 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  32.15 
 
 		 793 aa  263  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  30.93 
 
 		 750 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  31.57 
 
 		 635 aa  258  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  33.28 
 
 		 584 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  33.28 
 
 		 584 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  31.42 
 
 		 736 aa  249  9e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  31.2 
 
 		 799 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  30.61 
 
 		 630 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.84 
 
 		 641 aa  243  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  31.41 
 
 		 738 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  29.16 
 
 		 783 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  29 
 
 		 728 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  31.42 
 
 		 747 aa  236  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1043  general secretion pathway protein D  33.06 
 
 		 584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  31.56 
 
 		 636 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  28.72 
 
 		 807 aa  230  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  31.26 
 
 		 702 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  28.02 
 
 		 732 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  29.59 
 
 		 753 aa  229  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  29.17 
 
 		 648 aa  226  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  29.35 
 
 		 803 aa  224  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 740 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  30.5 
 
 		 632 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 757 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  41.03 
 
 		 744 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 750 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  40.26 
 
 		 781 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 757 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  39.06 
 
 		 771 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  41.27 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  39.06 
 
 		 777 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  25.11 
 
 		 892 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03176  general secretory pathway component, cryptic  52.41 
 
 		 338 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03127  hypothetical protein  52.41 
 
 		 338 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0771412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>