More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1329 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1329  peroxiredoxin, Ohr subfamily  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2949  OsmC family protein  97.87 
 
 
141 aa  278  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0402  OsmC family protein  87.94 
 
 
141 aa  263  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0520  OsmC family protein  87.23 
 
 
141 aa  261  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.942012  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5955  OsmC family protein  78.72 
 
 
141 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.520238  normal  0.500697 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1107  organic hydroperoxide resistance protein  75.89 
 
 
141 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.463779  normal  0.729784 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0130  OsmC family protein  75 
 
 
141 aa  228  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.677279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0224  OsmC family protein  76.43 
 
 
141 aa  227  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222589  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6064  OsmC family protein  80.14 
 
 
141 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3445  OsmC family protein  75.18 
 
 
141 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3098  OsmC family protein  75.18 
 
 
141 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0897  OsmC family protein  75.89 
 
 
141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2630  OsmC family protein  75.89 
 
 
141 aa  223  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120644  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5771  OsmC-like protein  78.72 
 
 
141 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6136  OsmC family protein  78.72 
 
 
141 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6618  OsmC family protein  78.01 
 
 
141 aa  221  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0787465 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7670  OsmC-like protein  78.72 
 
 
141 aa  221  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.470182  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2195  Ohr  75.54 
 
 
142 aa  219  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365953  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5713  OsmC family protein  77.3 
 
 
141 aa  216  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.295577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4590  OsmC-like protein  72.34 
 
 
141 aa  213  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.528482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5602  OsmC family protein  78.72 
 
 
141 aa  209  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03888  organic hydroperoxide resistance protein  71.22 
 
 
142 aa  209  9e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5559  OsmC-like protein  69.5 
 
 
140 aa  208  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5683  OsmC family protein  73.76 
 
 
141 aa  206  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.093671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1354  OsmC family protein  67.38 
 
 
141 aa  205  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0518  OsmC family protein  68.79 
 
 
142 aa  204  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0622  OsmC-like protein  68.84 
 
 
141 aa  203  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3618  organic hydroperoxide resistance protein OhrB  66.67 
 
 
140 aa  201  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0574  OsmC-like protein  65.22 
 
 
142 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.470604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15290  organic hydroperoxide resistance protein (OsmC family)  69.85 
 
 
142 aa  195  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.043985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1859  OsmC family protein  65.19 
 
 
142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3627  OsmC-like protein  66.42 
 
 
139 aa  194  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000186572  normal  0.0859541 
 
 
 
NC_008825  Mpe_A0058  putative organic hydroperoxide resistance protein  71.94 
 
 
142 aa  194  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1767  organic hydroperoxide resistance protein  66.42 
 
 
139 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3855  OsmC family protein  64.93 
 
 
142 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0700851  normal  0.118615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3997  OsmC-like protein  64.71 
 
 
139 aa  192  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000925834  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2080  OsmC family protein  63.57 
 
 
141 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.378208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1469  OsmC family protein  62.96 
 
 
142 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.777452  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1434  OsmC family protein  64.18 
 
 
142 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27220  organic hydroperoxide resistance protein  70 
 
 
142 aa  188  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2232  OsmC-like protein  64.96 
 
 
139 aa  185  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22057  normal  0.292696 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3232  OsmC family protein  63.77 
 
 
139 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3761  OsmC family protein  63.77 
 
 
139 aa  183  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80591  hitchhiker  0.00132961 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1642  peroxiredoxin, Ohr subfamily  65.96 
 
 
142 aa  181  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0422  OsmC family protein  60.87 
 
 
140 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163658  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0577  OsmC family protein  65.69 
 
 
140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025677  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3663  OsmC family protein  63.04 
 
 
139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367985  normal  0.784642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4500  OsmC-like protein  63.04 
 
 
139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095211  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3864  OsmC family protein  63.04 
 
 
139 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0291901  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4765  OsmC family protein  70.07 
 
 
141 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0377  OsmC-like protein  63.77 
 
 
141 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2305  organic hydroperoxide resistance protein  70 
 
 
142 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.43609  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3292  OsmC family protein  61.31 
 
 
140 aa  179  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.274194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6798  OsmC family protein  62.77 
 
 
139 aa  179  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000354891  decreased coverage  0.0000000499481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0885  organic hydroperoxide resistance protein  60.58 
 
 
140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4255  OsmC family protein  66.9 
 
 
141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.97654 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4881  OsmC family protein  61.31 
 
 
139 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225177  hitchhiker  0.00150856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2843  organic hydroperoxide resistance protein  62.77 
 
 
139 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151375  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1104  OsmC family protein  64.29 
 
 
143 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0062  OsmC family protein  63.04 
 
 
142 aa  176  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2423  organic hydroperoxide resistance protein  62.04 
 
 
139 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3253  organic hydroperoxide resistance protein  58.16 
 
 
141 aa  176  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.726693  normal  0.434532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0863  organic hydroperoxide resistance protein  62.04 
 
 
139 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.188106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2560  hypothetical protein  62.04 
 
 
139 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0303  organic hydroperoxide resistance protein  62.04 
 
 
139 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1482  organic hydroperoxide resistance protein  62.04 
 
 
139 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1196  organic hydroperoxide resistance protein  64.29 
 
 
143 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1678  organic hydroperoxide resistance protein  61.31 
 
 
139 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0829  organic hydroperoxide resistance protein  59.85 
 
 
140 aa  174  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0334  organic hydroperoxide resistance protein  61.31 
 
 
139 aa  174  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.782303  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0597  organic hydroperoxide resistance protein  61.31 
 
 
139 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1671  OsmC family protein  65.73 
 
 
142 aa  168  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.540231  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4272  OsmC family protein  56.12 
 
 
138 aa  167  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0619727  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0473  OsmC family protein  55.4 
 
 
138 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0482  OsmC family protein  55.4 
 
 
138 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0376835 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03141  putative organic hydroperoxide resistance protein  56.52 
 
 
142 aa  166  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.499234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2250  OsmC family protein  58.39 
 
 
140 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316574  normal  0.393622 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0819  OsmC family protein  57.25 
 
 
140 aa  166  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0302641  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0814  OsmC family protein  58.39 
 
 
140 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.245539  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0927  OsmC family protein  58.39 
 
 
140 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.595289  normal  0.478817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1190  organic hydroperoxide resistance protein  57.66 
 
 
140 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.481185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1067  OsmC family protein  57.04 
 
 
141 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0101  OsmC-like protein  54.68 
 
 
142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0109  organic hydroperoxide resistance protein  60.56 
 
 
141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1195  OsmC family protein  55.4 
 
 
138 aa  156  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3140  peroxiredoxin, Ohr subfamily  58.52 
 
 
147 aa  156  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0933  OsmC family protein  61.76 
 
 
141 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.015956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2416  OsmC family protein  62.41 
 
 
141 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.19201  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2711  OsmC family protein  61.7 
 
 
141 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.762501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2488  OsmC family protein  61.7 
 
 
141 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4967  OsmC family protein  55 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4428  OsmC family protein  52.14 
 
 
139 aa  147  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.49073  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1204  OsmC family protein  54.35 
 
 
140 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0357718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1177  OsmC-like protein  54.35 
 
 
140 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.772559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1194  OsmC family protein  54.35 
 
 
140 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3964  peroxiredoxin, Ohr subfamily  55 
 
 
141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7220  OsmC family protein  52.14 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2464  OsmC-like protein  51.8 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2850  OsmC family protein  61.76 
 
 
141 aa  144  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.77711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2206  OsmC-like protein  53.57 
 
 
150 aa  144  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>