42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1072 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 143 aa  296  5e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  97.2 
 
 		 143 aa  290  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  90.21 
 
 		 143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  45 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  45 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  39.42 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  41.73 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.61 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  95.9  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  34.48 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.84 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  36.84 
 
 		 138 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  35.19 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.24 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  30.65 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  30.65 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  28.24 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  28.24 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  28.23 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  25.95 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  25.21 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  38.05 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  25.58 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  28.23 
 
 		 135 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  29.84 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  32.71 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  28.45 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  25.95 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  27.42 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34020  hypothetical protein  30.97 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311323  normal  0.0827701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2893  hypothetical protein  32.17 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  33.61 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  32.5 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1676  hypothetical protein  30.25 
 
 		 153 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0537  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  27.34 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  22.41 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2126  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2028  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>