263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0983 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  100 
 
 
152 aa  315  1e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  86.84 
 
 
152 aa  280  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  76.35 
 
 
152 aa  246  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  65.31 
 
 
151 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  65.31 
 
 
151 aa  206  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  65.31 
 
 
151 aa  206  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  59.03 
 
 
148 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  56.64 
 
 
157 aa  171  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  58.74 
 
 
149 aa  168  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  54.42 
 
 
164 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  55.56 
 
 
153 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  55.1 
 
 
153 aa  164  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  55.86 
 
 
152 aa  163  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  54.48 
 
 
166 aa  159  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  54.55 
 
 
157 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  52.03 
 
 
152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  48.65 
 
 
158 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.35 
 
 
149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  51.37 
 
 
148 aa  149  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  49.32 
 
 
149 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
181 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  48.98 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  45.52 
 
 
148 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50 
 
 
149 aa  143  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  47.26 
 
 
322 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  46.31 
 
 
152 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  51.37 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  46.94 
 
 
149 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  51.35 
 
 
148 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  45.64 
 
 
149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.66 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  45.52 
 
 
149 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  45.52 
 
 
149 aa  133  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  43.36 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  42.66 
 
 
147 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  42.66 
 
 
147 aa  131  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  42.66 
 
 
147 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  53.19 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.3 
 
 
151 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  41.96 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  41.96 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.95 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  47.55 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  41.26 
 
 
147 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  42.07 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  47.18 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  42.47 
 
 
149 aa  124  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.76 
 
 
148 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  45.27 
 
 
153 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  42.76 
 
 
148 aa  123  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.62 
 
 
152 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1880  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.14 
 
 
149 aa  122  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  42.64 
 
 
152 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  41.96 
 
 
370 aa  120  7e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.45 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.52 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  43.41 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  43.41 
 
 
152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  39.33 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.07 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1441  ribose 5-phosphate isomerase B  40.85 
 
 
151 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  46 
 
 
171 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.58 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  42.64 
 
 
154 aa  116  9e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.07 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  44.08 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  44.06 
 
 
145 aa  114  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  44.67 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  44.52 
 
 
163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  44.67 
 
 
151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  40 
 
 
149 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  37.32 
 
 
149 aa  114  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.56 
 
 
149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  41.33 
 
 
160 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0842  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.42 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1604  ribose-5-phosphate isomerase  40.69 
 
 
148 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0025055  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  41.1 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  39.37 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  43.92 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1606  ribose 5-phosphate isomerase B, putative  40 
 
 
148 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0889  ribose 5-phosphate isomerase B  39.72 
 
 
145 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  39.29 
 
 
148 aa  112  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  40.71 
 
 
150 aa  111  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  40.54 
 
 
157 aa  110  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  40.46 
 
 
149 aa  110  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>