148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0976 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  95.46 
 
 
507 aa  1005    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  100 
 
 
507 aa  1045    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  52.36 
 
 
514 aa  545  1e-154  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  42.08 
 
 
476 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6460  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  51.69 
 
 
347 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1400  glycosyl hydrolase 53  45.4 
 
 
415 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195161  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2123  glycosyl hydrolase 53 domain protein  44.65 
 
 
425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.052262  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6169  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  42.71 
 
 
342 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0209217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4875  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.24 
 
 
387 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.417928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3290  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.24 
 
 
387 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6329  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.6 
 
 
386 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6029  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  39.33 
 
 
390 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0780998  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2125  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.12 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.825854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1555  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.86 
 
 
612 aa  209  9e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.428291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1617  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.86 
 
 
606 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0588913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0857  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.03 
 
 
619 aa  203  6e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1318  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  37.04 
 
 
405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00527191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2961  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.11 
 
 
405 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00892323  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0917  glycosy hydrolase family protein  33.42 
 
 
400 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.671223  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3886  glycosy hydrolase family protein  33.42 
 
 
400 aa  189  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.371175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0972  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.42 
 
 
400 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.396202  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1279  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.33 
 
 
399 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000518384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1159  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.62 
 
 
373 aa  187  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0601771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04100  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.43 
 
 
557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03928  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  52.23 
 
 
181 aa  170  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2047  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.14 
 
 
377 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.074716  normal  0.58115 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03980  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.73 
 
 
566 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1480  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.91 
 
 
492 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04110  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.74 
 
 
399 aa  150  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0385  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.23 
 
 
732 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.677811  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3080  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.13 
 
 
777 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1066  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.43 
 
 
412 aa  147  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.980933  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14870  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.43 
 
 
916 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.44593  normal  0.0967933 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05727  Endo-beta-1,4-galactanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS6]  30.65 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0903691  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1003  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.71 
 
 
897 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.629221  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2256  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  30.7 
 
 
391 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.020335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0683  sigma-70 factor  31.61 
 
 
397 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481968  hitchhiker  0.000000266294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  39.18 
 
 
491 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2827  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.76 
 
 
650 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000305574  hitchhiker  0.00171331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  44.53 
 
 
571 aa  120  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1334  glycosyl hydrolase 53 protein  27.3 
 
 
480 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  42.66 
 
 
412 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  38.41 
 
 
503 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  35.06 
 
 
1413 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  38.3 
 
 
537 aa  100  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.67 
 
 
566 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  40.88 
 
 
563 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  40.15 
 
 
582 aa  97.8  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  35.77 
 
 
691 aa  93.2  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.78 
 
 
466 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  40.6 
 
 
897 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  38.81 
 
 
436 aa  90.9  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  37.96 
 
 
1139 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  28.16 
 
 
497 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.03 
 
 
507 aa  87  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  38.24 
 
 
401 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  35.9 
 
 
789 aa  86.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  42.97 
 
 
647 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  36.88 
 
 
2073 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.33 
 
 
737 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  36.84 
 
 
943 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  38.24 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  37.96 
 
 
560 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.85 
 
 
507 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  33.81 
 
 
1259 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  33.99 
 
 
472 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  35.82 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  34.81 
 
 
430 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  33.08 
 
 
503 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.56 
 
 
695 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  32.09 
 
 
957 aa  77.8  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  31.1 
 
 
963 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  31.82 
 
 
884 aa  77  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  35.71 
 
 
425 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  35.25 
 
 
1187 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  28.99 
 
 
771 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.58 
 
 
615 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.53 
 
 
794 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  32.14 
 
 
672 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 
618 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  32.35 
 
 
576 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  32.85 
 
 
569 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  31.85 
 
 
664 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  29.73 
 
 
494 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  25.93 
 
 
230 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.94 
 
 
510 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  29.71 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  27.53 
 
 
483 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  32.89 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.08 
 
 
487 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  31.39 
 
 
445 aa  60.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.83 
 
 
648 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  29.75 
 
 
487 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6876  glycoside hydrolase family 76  34.09 
 
 
514 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534141  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  30.37 
 
 
806 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  30.37 
 
 
806 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  30.37 
 
 
806 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 
806 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>