More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0951 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3178  ferric aerobactin receptor IutA  88.52 
 
 		 733 aa  1355    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.911837 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0782  TonB-dependent siderophore receptor  68.22 
 
 		 726 aa  1042    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5381  putative TonB-dependent receptor  48.7 
 
 		 764 aa  666    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0194  TonB-dependent siderophore receptor  68.08 
 
 		 726 aa  1037    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0918  TonB-dependent siderophore receptor  69.79 
 
 		 746 aa  1061    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0710  TonB-dependent siderophore receptor  68.22 
 
 		 726 aa  1042    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0304  TonB-dependent siderophore receptor  48.35 
 
 		 745 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244305  normal  0.816396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3720  TonB-dependent siderophore receptor  48.48 
 
 		 745 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00118596  normal  0.0278628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0951  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 732 aa  1491    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4630  ferric aerobactin receptor IutA  84.84 
 
 		 732 aa  1301    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61850  putative TonB-dependent receptor  48.97 
 
 		 742 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865386 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0299  TonB-dependent siderophore receptor  48.35 
 
 		 745 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000445581  hitchhiker  0.000163743 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0279  ferric aerobactin receptor precursor  44.67 
 
 		 723 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.652222  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000078  aerobactin siderophore receptor iutA  44.79 
 
 		 723 aa  596  1e-169  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.709087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 817 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  40.4 
 
 		 808 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1817  TonB-dependent siderophore receptor  40.25 
 
 		 808 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1056  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 698 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3089  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 		 758 aa  333  6e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0075  TonB-dependent receptor  31.51 
 
 		 751 aa  324  3e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.5792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4019  siderophore receptor  31.06 
 
 		 816 aa  295  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.752702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46640  siderophore receptor  30.92 
 
 		 813 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.010692  hitchhiker  0.000000903307 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5892  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 843 aa  282  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1106  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 		 755 aa  281  3e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2840  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 849 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000068938  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_003296  RS00873  ferric siderophore receptor outer membrane signal peptide protein  29.76 
 
 		 812 aa  267  7e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1118  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 839 aa  249  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220964  normal  0.940906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1430  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 738 aa  243  7.999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0582  TonB-dependent receptor, plug  26.98 
 
 		 709 aa  231  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000470025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1820  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 697 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000291802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1522  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 701 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2941  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 701 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.80569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2678  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00160385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06011  hypothetical protein  27.42 
 
 		 713 aa  204  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01762  hypothetical protein  25.96 
 
 		 714 aa  201  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1688  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00738992  normal  0.0180451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0392  TonB-dependent receptor, plug  27.57 
 
 		 717 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.829697  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0298  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 725 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000594671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0286  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 723 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000746849  unclonable  0.000000000233468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0291  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 725 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000897487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0303  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 725 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0401  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 723 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000584805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0977  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 718 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0286  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 723 aa  194  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000335146  unclonable  0.000000000154672 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0299  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00020356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1044  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 721 aa  191  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3733  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000345554  unclonable  0.000038397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1496  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 716 aa  187  8e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0029  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 716 aa  181  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.241491  normal  0.0713753 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0468  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 700 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  25.53 
 
 		 771 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2885  histidine kinase  26.2 
 
 		 704 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000018886  decreased coverage  0.000177766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4213  putative ferric aerobactin receptor  25.63 
 
 		 721 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2402  TonB-dependent receptor, plug  26.15 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000227129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2145  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 809 aa  164  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.085277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1394  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 713 aa  158  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0833322 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 739 aa  157  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 783 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3918  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 728 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.665207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 817 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0587  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 		 753 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4423.1  ferric aerobactin receptor  28.61 
 
 		 332 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  26.14 
 
 		 646 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  33.14 
 
 		 736 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 634 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.43 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  22.78 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0650  hemin receptor precursor  24.14 
 
 		 676 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.332086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  33.33 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 675 aa  67.8  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 670 aa  67  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2169  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.19 
 
 		 694 aa  67  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108589 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  30.25 
 
 		 656 aa  67.4  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3889  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.14 
 
 		 676 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000356309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3801  TonB-dependent hemin receptor HmuR  24.14 
 
 		 676 aa  66.6  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0122148  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0492  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 762 aa  65.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  31.87 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.91 
 
 		 690 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1506  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.26 
 
 		 617 aa  65.1  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  27.78 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 698 aa  64.7  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  27.78 
 
 		 659 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  27.78 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  27.78 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  27.78 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  27.78 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  22.73 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.54 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.54 
 
 		 614 aa  63.9  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05847  hypothetical protein  31.33 
 
 		 718 aa  63.9  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  30.54 
 
 		 614 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  29.94 
 
 		 614 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  33.09 
 
 		 593 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>