26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0791 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0791  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  100 
 
 
124 aa  255  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000168449  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0556  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  97.58 
 
 
124 aa  249  8.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000035991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3363  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  65.22 
 
 
128 aa  149  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000382153  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3483  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  64.66 
 
 
128 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000503276  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0555  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  63.11 
 
 
128 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000390603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0790  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding protein  63.64 
 
 
128 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000163331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3482  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  56.41 
 
 
136 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000591006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3362  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  52.14 
 
 
120 aa  120  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000035442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3759  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  48.28 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00050742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3972  hypothetical protein  48.28 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000267115  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3614  hypothetical protein  48.28 
 
 
115 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3546  MuA-transposase/repressor protein CI DNA-binding  49.56 
 
 
116 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0471  hypothetical protein  40.91 
 
 
90 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000925994  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1049  bacteriophage Mu transposase MuA  36.51 
 
 
662 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4367  hypothetical protein  37.7 
 
 
216 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.21984  normal  0.0748532 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1050  putative repressor protein  42.37 
 
 
174 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.678331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1665  transposase A  37.7 
 
 
671 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0643  transposase, putative  38.89 
 
 
715 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2068  integrase catalytic region  43.75 
 
 
738 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2115  integrase catalytic region  41.18 
 
 
738 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.245855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3365  Integrase catalytic region  38.71 
 
 
718 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.582921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3752  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 
772 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2603  putative cytoplasmic protein  28.93 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.715844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2615  hypothetical protein  28.93 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2726  hypothetical protein  28.1 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316487  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2562  putative cytoplasmic protein  28.1 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>