More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0650 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  71.39 
 
 		 1475 aa  1911    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  72.03 
 
 		 931 aa  1279    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  100 
 
 		 1422 aa  2929    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  73.12 
 
 		 1423 aa  1924    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  71.94 
 
 		 1457 aa  1925    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  36.9 
 
 		 1505 aa  715    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  80.43 
 
 		 1447 aa  2212    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  73.11 
 
 		 1437 aa  1957    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  37.85 
 
 		 1600 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  81.06 
 
 		 1428 aa  2188    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  37.52 
 
 		 1616 aa  695    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  32.37 
 
 		 1494 aa  503  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  32.37 
 
 		 1494 aa  503  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1487 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1495 aa  486  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  31.57 
 
 		 1517 aa  475  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  30.07 
 
 		 1527 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  30.48 
 
 		 1485 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1410 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  28.96 
 
 		 1197 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0145  YD repeat protein  53.1 
 
 		 361 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  31.14 
 
 		 1189 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1541 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1541 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1541 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1381 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1541 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  28.41 
 
 		 1553 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1541 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1541 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  30.22 
 
 		 1509 aa  366  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  28.12 
 
 		 1639 aa  364  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  29 
 
 		 1679 aa  357  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  28.32 
 
 		 1673 aa  350  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  28.99 
 
 		 1488 aa  348  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  28.62 
 
 		 1259 aa  344  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1400 aa  344  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1409 aa  331  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.74 
 
 		 1489 aa  330  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  26.7 
 
 		 1385 aa  327  7e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  27.68 
 
 		 1508 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  27.49 
 
 		 1518 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1411 aa  320  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.77 
 
 		 1528 aa  318  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  27.31 
 
 		 1446 aa  310  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  27.05 
 
 		 1495 aa  307  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1386 aa  300  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  26.32 
 
 		 1359 aa  294  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.69 
 
 		 1379 aa  285  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  27.21 
 
 		 1568 aa  281  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  25.83 
 
 		 1421 aa  279  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1419 aa  278  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  27.49 
 
 		 1614 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.9 
 
 		 1528 aa  270  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1551 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.66 
 
 		 1572 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1527 aa  261  9e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2870  YD repeat protein  27.92 
 
 		 2144 aa  259  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.3 
 
 		 1576 aa  260  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1611 aa  253  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 		 1531 aa  252  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1586 aa  251  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1595 aa  251  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 1547 aa  249  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1492 aa  247  9e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1550 aa  243  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1418 aa  241  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.75 
 
 		 1434 aa  240  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1466 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1520 aa  240  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1390 aa  239  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  29.45 
 
 		 924 aa  239  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1402 aa  238  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.13 
 
 		 1530 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.81 
 
 		 1560 aa  237  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1229 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  26.09 
 
 		 1609 aa  232  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  25.61 
 
 		 1586 aa  231  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.68 
 
 		 1626 aa  231  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0368  hypothetical protein  68.75 
 
 		 283 aa  229  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1554 aa  228  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1620 aa  225  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.9 
 
 		 1593 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  25.02 
 
 		 1140 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.49 
 
 		 1362 aa  213  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.47 
 
 		 1352 aa  213  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.04 
 
 		 1348 aa  212  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  26.56 
 
 		 1543 aa  210  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  26.26 
 
 		 1579 aa  211  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1552 aa  211  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  26.26 
 
 		 1428 aa  209  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0645  Rhs core protein  41.42 
 
 		 444 aa  208  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.746843 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2096 aa  207  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  25.55 
 
 		 1401 aa  207  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1368 aa  205  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2508  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1699 aa  201  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0105853  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  25.65 
 
 		 855 aa  196  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  27.52 
 
 		 867 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.95 
 
 		 1981 aa  195  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  26.3 
 
 		 866 aa  195  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>