More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0579 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  100 
 
 
262 aa  527  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  95.8 
 
 
262 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.43 
 
 
263 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.43 
 
 
262 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.43 
 
 
263 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  77.65 
 
 
262 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.38 
 
 
252 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.77 
 
 
252 aa  390  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  75.98 
 
 
273 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  76.19 
 
 
251 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.73 
 
 
254 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  73.23 
 
 
262 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.46 
 
 
258 aa  347  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.15 
 
 
284 aa  344  7e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  68.36 
 
 
271 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.8 
 
 
269 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  67.58 
 
 
271 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.88 
 
 
258 aa  341  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 
258 aa  338  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.1 
 
 
258 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.67 
 
 
273 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 
273 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.71 
 
 
258 aa  331  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.17 
 
 
257 aa  331  9e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 
256 aa  330  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  66.14 
 
 
257 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.49 
 
 
262 aa  322  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.57 
 
 
265 aa  321  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
258 aa  321  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.7 
 
 
256 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.83 
 
 
264 aa  318  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.85 
 
 
257 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.02 
 
 
272 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.75 
 
 
257 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.15 
 
 
266 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  62.85 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.78 
 
 
263 aa  311  9e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.87 
 
 
256 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
256 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
256 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
256 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.68 
 
 
256 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.48 
 
 
256 aa  308  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  64.68 
 
 
611 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  64.29 
 
 
256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  61.81 
 
 
266 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.85 
 
 
262 aa  305  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  65.08 
 
 
256 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.92 
 
 
258 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  63.53 
 
 
294 aa  291  6e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.25 
 
 
260 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  57.25 
 
 
260 aa  287  1e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  60.16 
 
 
254 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  47.83 
 
 
283 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  47.83 
 
 
283 aa  234  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  49.79 
 
 
276 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  45.52 
 
 
276 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  45.52 
 
 
276 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  43.64 
 
 
276 aa  225  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  47.21 
 
 
278 aa  223  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  49.58 
 
 
279 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  48.31 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  45.49 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  48.71 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  48.71 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  48.07 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  48.07 
 
 
276 aa  211  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  40 
 
 
286 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 
291 aa  191  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5450  ABC transporter related  38.98 
 
 
583 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0152019 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.74 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.54 
 
 
340 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  41.74 
 
 
593 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5181  ABC transporter related  38.65 
 
 
573 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  0.292066 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  34.38 
 
 
334 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  34.38 
 
 
334 aa  171  1e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.54 
 
 
548 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0537  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
444 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128807  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
609 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2440  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 
326 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  40.76 
 
 
568 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3292  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  37.36 
 
 
341 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  35.71 
 
 
543 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1777  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 
326 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000396246 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  33.97 
 
 
261 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1017  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.36 
 
 
351 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.937317 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0783  ABC transporter related  40.23 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.806728 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0578  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
464 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 
333 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
323 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0437  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 
330 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2838  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
328 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.840124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0422  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 
330 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>