More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0506 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.98 
 
 
319 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.923467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3604  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.56 
 
 
321 aa  475  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.88 
 
 
321 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.33 
 
 
316 aa  277  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112233  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7203  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  48.03 
 
 
348 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0566155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1600  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  49.02 
 
 
313 aa  255  8e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
336 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
336 aa  254  9e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.25 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.353707  normal  0.0409254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2383  dipeptide ABC transporter  46.84 
 
 
323 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
316 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.544656  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
340 aa  226  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112325  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0940  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.77 
 
 
338 aa  222  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0444198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
315 aa  220  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
330 aa  220  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
321 aa  218  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.166437  normal  0.409342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34320  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.29 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2531  ABC transporter permease  38.69 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
345 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
356 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.4442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24430  Binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
338 aa  198  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.276655  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.13 
 
 
328 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00770957  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3222  ABC transporter, permease protein  39.48 
 
 
316 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
311 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0364256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
310 aa  193  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.122408 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
311 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.06 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3089  nickel ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 
316 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  35.06 
 
 
306 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  36.04 
 
 
306 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  36.04 
 
 
306 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
308 aa  189  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4175  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.94 
 
 
314 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  35.71 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  35.71 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  35.71 
 
 
306 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2517  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  34.74 
 
 
306 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2959  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.95 
 
 
316 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
309 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195869  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
311 aa  185  7e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
314 aa  185  7e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.39 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
322 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
314 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
322 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
322 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.24 
 
 
336 aa  179  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
306 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  0.0482429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
306 aa  179  5.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18680  ABC transporter, inner membrane permease component  38.74 
 
 
318 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158207  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5256  putative ABC transporter (permease protein)  31.82 
 
 
313 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.132635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1224  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.86 
 
 
313 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4538  peptide ABC transporter, permease protein  37.7 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 
339 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1223  Nickel-transporting ATPase  32.74 
 
 
339 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0308435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4833  putative ABC transporter (permease protein)  37.06 
 
 
333 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.428785 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  33.63 
 
 
339 aa  177  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
315 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.24032  normal  0.535319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
313 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
318 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.448412  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4297  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
336 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259448  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  33.03 
 
 
336 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7174  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  37.5 
 
 
314 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.281542  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
313 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000789572  normal  0.0157107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
321 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
320 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.663455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.91 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0924  alkaline phosphatase  33.13 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  32.93 
 
 
339 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0881  alkaline phosphatase  33.13 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0920  alkaline phosphatase  33.13 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745476  normal  0.672413 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.589529  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.43 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.144815  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4097  dipeptide transporter permease DppB  32.43 
 
 
339 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  33.74 
 
 
336 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  33.43 
 
 
336 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
306 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  33.11 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
334 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3257  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0837  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  34.42 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>