More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0479 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  100 
 
 		 596 aa  1221    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.35 
 
 		 599 aa  303  7.000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  30.91 
 
 		 566 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.22 
 
 		 587 aa  292  1e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  33.11 
 
 		 592 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  30.29 
 
 		 614 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  32.95 
 
 		 625 aa  244  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  30.21 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  31.61 
 
 		 626 aa  241  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  29.02 
 
 		 623 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  29.85 
 
 		 619 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.49 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  31.51 
 
 		 615 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  31.26 
 
 		 613 aa  229  8e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  29.04 
 
 		 609 aa  229  8e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  29.77 
 
 		 608 aa  229  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.92 
 
 		 594 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  30.76 
 
 		 615 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  31.32 
 
 		 625 aa  226  8e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  29.93 
 
 		 616 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  32.6 
 
 		 613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  33.25 
 
 		 603 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  33 
 
 		 626 aa  220  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  32.25 
 
 		 626 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  30.28 
 
 		 611 aa  219  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  29.17 
 
 		 617 aa  219  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  31.84 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 603 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.64 
 
 		 603 aa  218  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  28.02 
 
 		 611 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  29.79 
 
 		 603 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  30.78 
 
 		 633 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  28.76 
 
 		 611 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  33.26 
 
 		 606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  29.6 
 
 		 619 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  30.07 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.38 
 
 		 605 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  30.04 
 
 		 618 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  31.44 
 
 		 618 aa  213  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  30.07 
 
 		 605 aa  210  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  26.86 
 
 		 627 aa  210  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  28.18 
 
 		 631 aa  209  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  28.81 
 
 		 621 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  29.41 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  29.21 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 		 621 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  28.57 
 
 		 621 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  34.16 
 
 		 606 aa  200  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 624 aa  198  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 		 603 aa  199  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  29.24 
 
 		 623 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  28.07 
 
 		 616 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  30.22 
 
 		 638 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1840  ABC transporter related  26.17 
 
 		 591 aa  193  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  29.18 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 596 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  31.81 
 
 		 625 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  28.29 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  27.16 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  32.13 
 
 		 618 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  32.25 
 
 		 500 aa  190  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  27.84 
 
 		 608 aa  189  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  28.12 
 
 		 662 aa  188  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.18 
 
 		 619 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3066  ABC transporter related  27.81 
 
 		 593 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000101983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  31.84 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  30.17 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  29.62 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.42 
 
 		 597 aa  183  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  34.95 
 
 		 870 aa  182  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.28 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  40.7 
 
 		 625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.06 
 
 		 633 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  29.85 
 
 		 567 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  27.42 
 
 		 616 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  29.85 
 
 		 567 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.26 
 
 		 610 aa  179  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.42 
 
 		 575 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.12 
 
 		 567 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  27.34 
 
 		 611 aa  177  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  28.55 
 
 		 608 aa  176  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2524  ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 423 aa  176  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00646333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0185  ABC transporter ATP-binding protein  37.12 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0942  ABC transporter related  33.96 
 
 		 622 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  33.43 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08280  ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporter with N-terminal double-glycine peptidase domain  33.57 
 
 		 607 aa  174  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0133225  normal  0.224616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  36.57 
 
 		 626 aa  173  7.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  28.68 
 
 		 604 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0045  ABC transporter, ATP-binding protein  24.84 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  28.19 
 
 		 593 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  29.95 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.8 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0526  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.15 
 
 		 582 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.15 
 
 		 582 aa  170  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3046  ABC transporter related  26.92 
 
 		 618 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.752635 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  36.3 
 
 		 572 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  39.17 
 
 		 1013 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  36.51 
 
 		 626 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1189  ABC transporter related  37.45 
 
 		 586 aa  167  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00259948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>