291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0476 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  89.52 
 
 		 371 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  744    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  39.53 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  38.58 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  37.64 
 
 		 395 aa  242  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  35.13 
 
 		 395 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  32.98 
 
 		 378 aa  212  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  34.71 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  34.13 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 408 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  33.69 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  33.52 
 
 		 431 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  34.56 
 
 		 390 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 430 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  34.99 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 387 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  31.9 
 
 		 491 aa  123  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  31.9 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  29.01 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  27.76 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  28.62 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  26.35 
 
 		 780 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  22.81 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.89 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  22.51 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  24.55 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1135  hypothetical protein  23.32 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0719  hypothetical protein  22.77 
 
 		 385 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.348943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  23.99 
 
 		 397 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  23.31 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  23.98 
 
 		 390 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.0000152274  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  20.86 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  20.81 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  20.86 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  20.86 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  20.86 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.39 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  23.93 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  22.97 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  23.99 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  24.85 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  22.43 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  22.67 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.54 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5303  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  22.44 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  23.87 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  23.05 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.87 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.57 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  24.85 
 
 		 901 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  21.65 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  24.14 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.11 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  23.55 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  20.75 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  28 
 
 		 901 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  24.3 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  28 
 
 		 901 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  23.15 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  20.54 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  27.23 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  26.15 
 
 		 901 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  22.59 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  21.89 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  23.44 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  21.61 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  26.58 
 
 		 911 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  24.86 
 
 		 921 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  20.92 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  23.06 
 
 		 691 aa  70.5  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  25.73 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  22.35 
 
 		 904 aa  70.5  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3666  hypothetical protein  23.1 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.335217  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  24.23 
 
 		 912 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  21.69 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  21.32 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  22.79 
 
 		 377 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0873  ABC-2 type transporter  21.94 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.344098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>