More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0198 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  67.4 
 
 
631 aa  882    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  52.75 
 
 
623 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  100 
 
 
631 aa  1293    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  52.35 
 
 
630 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  52.74 
 
 
631 aa  648    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  52.35 
 
 
630 aa  636    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  95.25 
 
 
631 aa  1239    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  50.94 
 
 
615 aa  631  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  50.55 
 
 
615 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  51.1 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4050  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  50.94 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00780594  decreased coverage  0.000540594 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4020  TonB-dependent vitamin B12 receptor  50.94 
 
 
614 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4200  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  51.1 
 
 
614 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101627  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4507  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  51.1 
 
 
614 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000315572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5430  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  51.1 
 
 
614 aa  610  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0043717  normal  0.0207602 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  49.61 
 
 
614 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  49.45 
 
 
614 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  49.61 
 
 
614 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  49.45 
 
 
614 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  49.45 
 
 
614 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  37.65 
 
 
611 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  37.29 
 
 
611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  34.17 
 
 
618 aa  340  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00261  phosphatidylglycerophosphatase  34.38 
 
 
617 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  31.54 
 
 
628 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  32.29 
 
 
1023 aa  260  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  32.57 
 
 
616 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  30.76 
 
 
617 aa  253  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.33 
 
 
619 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 
615 aa  250  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 
613 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.7 
 
 
616 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 
619 aa  238  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 
614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 
593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 
617 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.86 
 
 
613 aa  234  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  31.28 
 
 
614 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4773  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
624 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.386912  normal  0.53176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.17 
 
 
646 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 
626 aa  224  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 
626 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 
632 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 
602 aa  219  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1162  tonB-dependent vitamin B12 receptor  29.22 
 
 
622 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 
628 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3757  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 
612 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 
624 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  28.02 
 
 
645 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
627 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 
648 aa  210  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 
627 aa  210  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.61 
 
 
616 aa  209  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0273  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 
602 aa  210  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0292443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 
637 aa  205  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 
627 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  29.25 
 
 
641 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  28.07 
 
 
623 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
618 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 
642 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07860  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.57 
 
 
630 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  28.48 
 
 
628 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 
623 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
641 aa  190  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  28.93 
 
 
634 aa  188  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  28.19 
 
 
620 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  29.65 
 
 
690 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
697 aa  187  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1826  TonB-dependent receptor  28 
 
 
621 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568285  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  27.86 
 
 
695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 
597 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  27.51 
 
 
631 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
638 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  27.9 
 
 
638 aa  172  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0995  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 
629 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.864049  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3502  putative outer membrane cobalamin receptor, TonB dependent  26.56 
 
 
623 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.86203  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
624 aa  171  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0521  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
617 aa  169  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
613 aa  167  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 
627 aa  167  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
698 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
692 aa  160  5e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 
659 aa  160  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1639  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.84 
 
 
685 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.18341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2327  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.84 
 
 
685 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.52571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2959  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.84 
 
 
685 aa  160  9e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0834  vitamin B12 receptor BtuB, putative  27.21 
 
 
680 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.162621  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  25 
 
 
640 aa  159  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
625 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0685  vitamin B12 receptor BtuB, putative  26.84 
 
 
685 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.58 
 
 
621 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  26.51 
 
 
821 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1028  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.35 
 
 
685 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1035  putative TonB-dependent vitamin B12 receptor BtuB  26.35 
 
 
685 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127064  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  27.6 
 
 
655 aa  153  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0562  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.222662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  26.3 
 
 
650 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  26.3 
 
 
650 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 
647 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>