More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0092 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  98.43 
 
 		 191 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  80.1 
 
 		 199 aa  324  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  80.31 
 
 		 207 aa  314  4e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.39 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.39 
 
 		 220 aa  302  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  79.37 
 
 		 206 aa  302  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.39 
 
 		 220 aa  301  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 		 198 aa  293  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 		 198 aa  293  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  73.54 
 
 		 198 aa  291  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 		 198 aa  291  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 		 198 aa  291  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.54 
 
 		 198 aa  291  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  73.02 
 
 		 198 aa  290  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  72.49 
 
 		 198 aa  288  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  72.49 
 
 		 198 aa  288  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 207 aa  277  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 207 aa  277  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75 
 
 		 199 aa  276  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  75.53 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  64.29 
 
 		 199 aa  241  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  63.21 
 
 		 199 aa  240  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  62.64 
 
 		 199 aa  237  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  64.64 
 
 		 191 aa  234  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  59.46 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  58.2 
 
 		 209 aa  227  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  56.08 
 
 		 202 aa  224  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  57.98 
 
 		 215 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  57.98 
 
 		 215 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  57.45 
 
 		 215 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  55.72 
 
 		 212 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  59.12 
 
 		 221 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  56.19 
 
 		 193 aa  214  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  58.15 
 
 		 222 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  58.15 
 
 		 222 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  58.01 
 
 		 222 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  58.15 
 
 		 222 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  56.19 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  58.33 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  56.11 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  58.56 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  56.68 
 
 		 209 aa  208  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  58.56 
 
 		 195 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  55.56 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  50.26 
 
 		 203 aa  200  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  54.59 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  54.59 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  50.27 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  54.21 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  53.44 
 
 		 194 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  53.26 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  54.05 
 
 		 200 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  53.44 
 
 		 196 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  54.14 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  51.67 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  51.67 
 
 		 193 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  53.3 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  52.46 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  50.26 
 
 		 196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  47.37 
 
 		 216 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  52.15 
 
 		 200 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  49.19 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  48.68 
 
 		 205 aa  177  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  51.4 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.21 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  51.85 
 
 		 228 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  49.72 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  52.2 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  51.96 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  47.78 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  48.91 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  47.22 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3223  putative methylase  48.6 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  45 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  47.25 
 
 		 214 aa  144  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  42.61 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  42.61 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  46.15 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  42.63 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  44.9 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  46.15 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  44.75 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  43.62 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  44.24 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  40.84 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  45.03 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  45.96 
 
 		 204 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  48.37 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  41.54 
 
 		 218 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  43.08 
 
 		 218 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  41.34 
 
 		 179 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  47.34 
 
 		 204 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  46.99 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4139  hypothetical protein  45.92 
 
 		 204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0563  putative methyltransferase  47.28 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  47.34 
 
 		 204 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  48.68 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>