31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0090 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0090  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0095  hypothetical protein  98.1 
 
 
106 aa  209  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4068  hypothetical protein  86.11 
 
 
108 aa  191  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3983  hypothetical protein  83.81 
 
 
106 aa  184  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0573  hypothetical protein  83.81 
 
 
106 aa  184  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0235  hypothetical protein  83.81 
 
 
106 aa  184  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.135682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3880  hypothetical protein  82.41 
 
 
108 aa  184  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0041  hypothetical protein  57.94 
 
 
107 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00044  hypothetical protein  52.25 
 
 
111 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1072  hypothetical protein  49.49 
 
 
111 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09110  hypothetical protein  48.04 
 
 
109 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4840  hypothetical protein  48.48 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4662  hypothetical protein  47.47 
 
 
108 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236064  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4786  hypothetical protein  47.47 
 
 
108 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0776376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3777  hypothetical protein  46.73 
 
 
107 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.171808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2030  hypothetical protein  47.12 
 
 
112 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1129  hypothetical protein  46.15 
 
 
110 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12360  hypothetical protein  46.15 
 
 
110 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4344  hypothetical protein  43.81 
 
 
108 aa  104  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0697  Domain of unknown function DUF1820  47 
 
 
113 aa  104  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.11201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0634  hypothetical protein  45.92 
 
 
122 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00145233  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4803  hypothetical protein  43.81 
 
 
108 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806078  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4949  hypothetical protein  42.57 
 
 
109 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3299  hypothetical protein  43.43 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.222898 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0852  hypothetical protein  44.55 
 
 
112 aa  95.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000734033  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1180  hypothetical cytosolic protein  44.55 
 
 
112 aa  95.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000108466  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1506  hypothetical protein  41.41 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1477  hypothetical protein  41.41 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03549  hypothetical protein  43.3 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0366  hypothetical protein  44.71 
 
 
106 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0330  hypothetical protein  44.71 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>