More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0082 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  100 
 
 		 310 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  97.42 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  83.55 
 
 		 310 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  80.97 
 
 		 310 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  80.25 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  80.25 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  80.25 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  76.7 
 
 		 310 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  74.03 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  74.03 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  73.62 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  74.03 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  74.03 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  74.03 
 
 		 309 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  74.03 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  74.03 
 
 		 309 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  73.7 
 
 		 309 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  74.03 
 
 		 309 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  52.61 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  51.94 
 
 		 307 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  51.29 
 
 		 307 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.8 
 
 		 311 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  47.47 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  47.74 
 
 		 314 aa  278  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  47.88 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  45.78 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.59 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  47.18 
 
 		 298 aa  255  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.02 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  44.98 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.72 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.2 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.38 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  44.92 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44.01 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  45.31 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  38.98 
 
 		 326 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  41.39 
 
 		 305 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  38.87 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  36.3 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.97 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  38.94 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  40.88 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.69 
 
 		 290 aa  199  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.28 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  34.87 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.62 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  38.28 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  40.88 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.5 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.87 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  36.18 
 
 		 311 aa  176  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  35.22 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  39.2 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.1 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.91 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  35.88 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  35.99 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.63 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.91 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.8 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  29.9 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  29.9 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  29.96 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  41.72 
 
 		 153 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  24.67 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  32.63 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  32.63 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  31.32 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  32.14 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  30.28 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  29.22 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.6 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  31.35 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  28.33 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  31.71 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.08 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.6 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.6 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 308 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 		 308 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  30.85 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  30.84 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  30.85 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  30.85 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 		 312 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  29.75 
 
 		 339 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>