61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0074 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0074  cellulose synthase operon protein YhjQ  100 
 
 		 245 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0077  cellulose synthase operon protein YhjQ  95.1 
 
 		 245 aa  480  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0147  YhjQ family protein  61.89 
 
 		 245 aa  314  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3940  cell division protein  51.88 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4022  cell division protein  51.88 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0183  cell division protein  51.88 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3843  cell division protein  51.46 
 
 		 250 aa  258  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  0.531218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3936  cell division protein  50.41 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  0.939628 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3892  cell division protein  50.41 
 
 		 250 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.883343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3931  cell division protein  51.88 
 
 		 250 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.618843  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3815  cell division protein  50 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0618266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3996  cell division protein  50.81 
 
 		 250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3828  cell division protein  50 
 
 		 250 aa  251  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0179  cellulose synthase operon protein YhjQ  51.52 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03335  hypothetical protein  51.74 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.616854  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3198  cellulose synthase, putative  38.33 
 
 		 235 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2135  cellulose synthase, putative  36.97 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2634  cellulose synthase, putative  36.97 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3257  cellulose synthase operon protein YhjQ  30.56 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116604  normal  0.940064 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2039  hypothetical protein  29.57 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0864058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5835  cellulose synthase operon protein YhjQ  29.72 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05100  ATPase  31.84 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3941  hypothetical protein  27.6 
 
 		 267 aa  86.3  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0933  hypothetical protein  27.49 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1026  cell morphology protein  30.18 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.731129  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3896  cellulose synthase operon protein YhjQ  24.58 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4084  cellulose synthase operon protein YhjQ  25.42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3340  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.39 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1362  chromosome partitioning-like ATPase  25.41 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0676694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.24 
 
 		 270 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1296  chromosome partitioning ATPase  24.29 
 
 		 262 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.150135  normal  0.0505256 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0902  chromosome partitioning ATPase protein-like  25.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1384  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  25.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1262  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  23.89 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343688  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3522  hypothetical protein  26.94 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4093  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 285 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.164046  normal  0.0132067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2255  hypothetical protein  24.18 
 
 		 251 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1922  chromosome partitioning ATPase  25.41 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  23.98 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1836  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.87 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.267562  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  25.1 
 
 		 309 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3145  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.61 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.46037  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4529  chromosome partitioning ATPase  25 
 
 		 259 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0076  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.57 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00028  chromosome partioning protein  25.46 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.287581  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  23.17 
 
 		 256 aa  45.4  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.75 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4216  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.57 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.18 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4840  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.73 
 
 		 337 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0446  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.496644  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 		 313 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K15  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain protein  31.67 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000000399891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2961  chromosome segregation ATPase  24 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 313 aa  42.4  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0118  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.02 
 
 		 240 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2478  chromosome partitioning ATPase  25.17 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 287 aa  42  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1026  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.77 
 
 		 282 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>