80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0070 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  50.47 
 
 		 1157 aa  1128    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3927  cellulose synthase subunit BcsC  50.31 
 
 		 1160 aa  1127    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2139  cellulose synthase subunit BcsC  40.41 
 
 		 1172 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0073  cellulose synthase subunit BcsC  92.01 
 
 		 1164 aa  2141    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  50.96 
 
 		 1140 aa  1128    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0151  cellulose synthase subunit BcsC  67.73 
 
 		 1157 aa  1620    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  50.64 
 
 		 1157 aa  1132    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3194  cellulose synthase subunit BcsC  40.07 
 
 		 1186 aa  794    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  50.64 
 
 		 1157 aa  1132    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0070  cellulose synthase subunit BcsC  100 
 
 		 1159 aa  2352    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.494386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3888  cellulose synthase subunit BcsC  49.96 
 
 		 1180 aa  1103    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3932  cellulose synthase subunit BcsC  50.22 
 
 		 1150 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.903843  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  50.64 
 
 		 1157 aa  1132    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3811  cellulose synthase subunit BcsC  50.22 
 
 		 1172 aa  1113    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.805678 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3824  cellulose synthase subunit BcsC  50.13 
 
 		 1150 aa  1113    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3992  cellulose synthase subunit BcsC  50.17 
 
 		 1180 aa  1110    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.416047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2638  cellulose synthase subunit BcsC  40.39 
 
 		 1172 aa  786    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  50.9 
 
 		 1157 aa  1138    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0183  cellulose synthase operon C domain protein  50.56 
 
 		 1157 aa  1129    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3734  cellulose synthase operon protein C, truncation  64.85 
 
 		 289 aa  379  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2252  cellulose synthase operon C-like protein  29.1 
 
 		 1267 aa  232  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0439618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3525  TPR repeat-containing cellulose synthase operon C  29.68 
 
 		 1265 aa  230  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  35.81 
 
 		 1271 aa  213  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1293  cellulose synthase domain-containing protein  29.93 
 
 		 1315 aa  210  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.140403  normal  0.0429961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1924  cellulose synthase domain-containing protein  30.15 
 
 		 1313 aa  209  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.107111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1260  cellulose synthase domain-containing protein  29.9 
 
 		 1315 aa  208  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.00414022  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4527  cellulose synthase operon C-like protein  29.91 
 
 		 1259 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279468  normal  0.779984 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1359  cellulose synthase domain-containing protein  30.2 
 
 		 1297 aa  197  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  33.42 
 
 		 1230 aa  195  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1381  cellulose synthase domain-containing protein  30.05 
 
 		 1297 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0899  cellulose synthase operon C-like  30.05 
 
 		 1297 aa  195  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0140357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0631  cellulose synthase operon protein C  33.33 
 
 		 1548 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0793  cellulose synthase operon protein C  34.18 
 
 		 1471 aa  187  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.567802  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2230  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1544 aa  186  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56695  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0687  cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1580 aa  186  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.963088  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2009  cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1574 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.175736  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2144  putative cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1574 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1588  cellulose synthase operon protein C  33.16 
 
 		 1266 aa  183  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.502666  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  28.89 
 
 		 1588 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  28.13 
 
 		 1569 aa  171  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  27.91 
 
 		 1542 aa  169  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2072  cellulose synthase domain-containing protein  30.6 
 
 		 1244 aa  167  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00026145 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3938  cellulose synthase domain-containing protein  34.77 
 
 		 1324 aa  161  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0915294 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05080  cellulose synthase subunit C  31.31 
 
 		 1367 aa  152  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3893  cellulose synthase operon C domain protein  32.75 
 
 		 1331 aa  145  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4081  cellulose synthase operon C domain protein  29.43 
 
 		 1309 aa  105  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00790  cellulose synthase operon protein C  25.76 
 
 		 815 aa  66.2  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 417 aa  57.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 321 aa  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 594 aa  51.6  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0523  TPR repeat-containing protein  19.62 
 
 		 302 aa  49.3  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.15246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 265 aa  48.5  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 673 aa  48.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 		 927 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 390 aa  47.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  34.56 
 
 		 1333 aa  47.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 2262 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 265 aa  47.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 767 aa  47.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 643 aa  48.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1297 aa  46.6  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 363 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42758  predicted protein  22.07 
 
 		 1346 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.59748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 363 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0195  TPR domain protein  35.62 
 
 		 379 aa  45.8  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.315867  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.79 
 
 		 810 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.38 
 
 		 1013 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.9 
 
 		 2240 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 786 aa  45.8  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 1252 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.27 
 
 		 1737 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 3145 aa  45.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 722 aa  45.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0640  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 516 aa  45.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 		 1154 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 		 344 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1197 aa  44.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 344 aa  45.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 292 aa  45.1  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.86 
 
 		 142 aa  44.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>