224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0040 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0040  heat shock chaperone IbpB  100 
 
 
150 aa  309  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0035  heat shock chaperone IbpB  97.99 
 
 
149 aa  300  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0012  heat shock chaperone IbpB  76.97 
 
 
154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3794  heat shock chaperone IbpB  76.97 
 
 
154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.82162  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4142  heat shock chaperone IbpB  76.97 
 
 
154 aa  241  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0049  heat shock chaperone IbpB  83.21 
 
 
142 aa  237  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.206343 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3913  heat shock chaperone IbpB  76 
 
 
149 aa  235  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4104  heat shock chaperone IbpB  81.43 
 
 
149 aa  232  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0014  heat shock chaperone IbpB  71.83 
 
 
142 aa  212  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4197  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
142 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4018  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
142 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4090  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
142 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4035  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
142 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4139  heat shock chaperone IbpB  71.13 
 
 
142 aa  208  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0017  heat shock protein Hsp20  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4051  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5118  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.238843 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4194  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3898  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0017  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03513  hypothetical protein  66.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4233  heat shock chaperone IbpB  66.2 
 
 
142 aa  197  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03569  heat shock chaperone  64.66 
 
 
133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5071  heat shock protein Hsp20  49.01 
 
 
156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5016  heat shock protein Hsp20  49.01 
 
 
156 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4556  heat shock protein Hsp20  49.01 
 
 
156 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1115  heat shock protein Hsp20  50 
 
 
160 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2668  heat shock protein HSP20  50.34 
 
 
147 aa  140  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000229058  decreased coverage  0.000680468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1953  heat shock protein Hsp20  48.61 
 
 
146 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3646  heat shock protein Hsp20  45.95 
 
 
148 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498726  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2134  heat shock protein Hsp20  49.31 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1971  heat shock protein Hsp20  49.66 
 
 
154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2140  heat shock protein Hsp20  47.26 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0232809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2020  16 kDa heat shock protein A  47.92 
 
 
147 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0459252  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002003  heat shock protein A  47.86 
 
 
145 aa  137  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1748  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 
147 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0323144  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1828  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 
147 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122774  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2271  heat shock protein Hsp20  47.52 
 
 
147 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00909432  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2277  16 kDa heat shock protein A  47.52 
 
 
147 aa  136  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1971  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
147 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191166  hitchhiker  0.0000381021 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2388  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
147 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00175284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2376  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
147 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0181083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2492  heat shock protein Hsp20  46.81 
 
 
147 aa  135  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00176998  hitchhiker  0.00301221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4630  heat shock protein Hsp20  43.15 
 
 
162 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127451  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00446  heat shock protein  48.57 
 
 
145 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4263  heat shock protein Hsp20  43.15 
 
 
167 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.135314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03570  heat shock chaperone  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0016  heat shock protein Hsp20  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0016  heat shock protein IbpA  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4052  heat shock protein IbpA  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4232  heat shock protein IbpA  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03514  hypothetical protein  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5119  heat shock protein IbpA  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.188059 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3899  heat shock protein IbpA  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4195  heat shock protein IbpA  48.18 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1728  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
155 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1909  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
146 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0679931  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0695  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0703839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3679  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 
160 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3725  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 
160 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2006  heat-shock protein IbpA  47.92 
 
 
149 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4198  heat shock protein IbpA  47.45 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4091  heat shock protein IbpA  47.45 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4036  heat shock protein IbpA  47.45 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4140  heat shock protein IbpA  47.45 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23680  heat-shock protein IbpA  47.92 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4019  heat shock protein IbpA  47.45 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38620  heat shock protein Hsp20  47.33 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3739  small heat shock protein  45.71 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3816  heat shock protein Hsp20  47.1 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1373  small heat shock protein  43.51 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.272184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1982  heat shock protein Hsp20  47.55 
 
 
149 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.01007  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0410  heat shock protein Hsp20  45.83 
 
 
155 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390221  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34300  heat shock protein IbpA  47.59 
 
 
147 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38610  heat shock protein Hsp20  46.67 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2501  16 kDa heat shock protein A  45.71 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3892  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3020  heat shock protein Hsp20  47.89 
 
 
165 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2505  heat shock protein Hsp20  47.83 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2126  heat shock protein Hsp20  47.26 
 
 
150 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0230885  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1545  heat shock protein Hsp20  47.55 
 
 
147 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0013  heat shock protein IbpA  46.32 
 
 
136 aa  130  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4119  heat shock protein Hsp20  45.64 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.336611  normal  0.508769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0433  heat shock protein Hsp20  43.62 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2961  small heat shock protein  43.88 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3914  heat shock protein IbpA  47.79 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0048  heat shock protein IbpA  46.38 
 
 
137 aa  128  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.208212 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1513  heat shock protein Hsp20  47.59 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0039  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2837  molecular chaperone (small heat shock protein)  45.1 
 
 
160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00175036  normal  0.201531 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3877  heat shock protein Hsp20  44.37 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.446606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3036  small heat shock protein, HSP20-like chaperone  47.45 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0929913  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3777  heat shock protein Hsp20  46.85 
 
 
147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.732741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0034  heat shock protein IbpA  48.53 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2821  heat shock protein Hsp20  44.81 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13645  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1016  small heat shock protein  44.52 
 
 
158 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.127734  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2213  heat shock protein Hsp20  46.53 
 
 
157 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2892  putative small heat shock (HSP20) protein  44.9 
 
 
152 aa  128  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00328323  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0559  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
154 aa  128  3e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.996724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0212  heat shock protein Hsp20  46.04 
 
 
158 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.734603  normal  0.555417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>