More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5125 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  74.67 
 
 		 449 aa  684    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  100 
 
 		 450 aa  912    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  84.28 
 
 		 450 aa  760    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  81.69 
 
 		 450 aa  731    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  82.89 
 
 		 450 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  61.69 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  58.05 
 
 		 457 aa  531  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  59.68 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  58.74 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  58.56 
 
 		 454 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  57.59 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  55.81 
 
 		 458 aa  500  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  57.46 
 
 		 452 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  57.3 
 
 		 445 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  56.4 
 
 		 445 aa  489  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  57.05 
 
 		 452 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  55.56 
 
 		 460 aa  471  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  56.32 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  55.33 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.43 
 
 		 452 aa  468  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  52.88 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.79 
 
 		 441 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.81 
 
 		 457 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  54.1 
 
 		 455 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  55.07 
 
 		 441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  53.99 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.9 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.37 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.2 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  52.39 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  50.34 
 
 		 440 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  51.69 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.36 
 
 		 447 aa  431  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  52.39 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  51.84 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  52.8 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  52.53 
 
 		 447 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  51.24 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  51 
 
 		 447 aa  425  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.86 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  50.11 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.77 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  50.9 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.5 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.77 
 
 		 441 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  50 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.11 
 
 		 453 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  49.77 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  48.61 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.52 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.34 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  49.89 
 
 		 445 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  51.36 
 
 		 451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  48.52 
 
 		 443 aa  399  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.2 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.17 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  48.18 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.63 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.27 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  51.03 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  47.45 
 
 		 1121 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  49 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  49.44 
 
 		 444 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  49.21 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  48.74 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.33 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  50 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  46.86 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  46.82 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.66 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  48.97 
 
 		 444 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  47.85 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  51.93 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  50.34 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  48.39 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.92 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  46.36 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  44.39 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  44.7 
 
 		 451 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.72 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  47.16 
 
 		 492 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.6 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.98 
 
 		 445 aa  362  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.1 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  45.09 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  46.88 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  45.9 
 
 		 451 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  44.52 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.62 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  45.82 
 
 		 454 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  45.31 
 
 		 445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  44.82 
 
 		 442 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  44.37 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  46.58 
 
 		 469 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  45.88 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  43.08 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  43.08 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  43.08 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  43.08 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  43.08 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>