More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5056 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  610  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  66.45 
 
 		 316 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0403  ABC transporter, ATP-binding protein  64.14 
 
 		 305 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  63.25 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  62.67 
 
 		 323 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  60.33 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  60.66 
 
 		 326 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.72 
 
 		 311 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  61.51 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  61.87 
 
 		 322 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  62.96 
 
 		 328 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  58.61 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0349  ABC transporter-related protein  61.76 
 
 		 328 aa  364  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  60.33 
 
 		 313 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  58.36 
 
 		 318 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  59.74 
 
 		 314 aa  358  8e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  60 
 
 		 317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  61.06 
 
 		 323 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  59.74 
 
 		 323 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  60.07 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0408  ABC transporter related  60.91 
 
 		 331 aa  346  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.300517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0699  ATPase  58.14 
 
 		 354 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3130  ABC transporter component  63.39 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00961649  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  55.97 
 
 		 312 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0457  ABC transporter related  58.54 
 
 		 331 aa  331  9e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0665642  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  55.63 
 
 		 309 aa  329  3e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  54.4 
 
 		 308 aa  317  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  61.9 
 
 		 691 aa  316  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1341  ABC transporter related  54.63 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  48.05 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  45.72 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  45.89 
 
 		 319 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  50.34 
 
 		 315 aa  261  8.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  49.51 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  48.88 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  46.2 
 
 		 319 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  44.74 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.02 
 
 		 316 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  47.87 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  46.05 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  45.39 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  43 
 
 		 314 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0738  hypothetical protein  41.18 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  50.95 
 
 		 270 aa  242  7e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  51.38 
 
 		 512 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.26 
 
 		 333 aa  240  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.88 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0719  hypothetical protein  40.48 
 
 		 308 aa  239  4e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  41.02 
 
 		 307 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  50.91 
 
 		 510 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  50.46 
 
 		 255 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  43.23 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3070  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 307 aa  232  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127936  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.2 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  44.07 
 
 		 346 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  44.41 
 
 		 346 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  40.2 
 
 		 308 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  44.07 
 
 		 346 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  53.99 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  44.11 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  44.11 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  44.11 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  44.11 
 
 		 318 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  46.64 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  44.26 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  38.13 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  45.13 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  49.76 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  45.13 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40.33 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  41.89 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.54 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1421  ABC transporter related  42.52 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  41.47 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  38.82 
 
 		 667 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 589 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  47.23 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 340 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 308 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  39.53 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 580 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  46.61 
 
 		 580 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 583 aa  217  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  43.75 
 
 		 275 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  41.25 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 307 aa  215  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  48.39 
 
 		 582 aa  215  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  44.55 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 		 578 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>