More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5022 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.71 
 
 		 399 aa  674    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  84.71 
 
 		 399 aa  683    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  80.05 
 
 		 401 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  80.3 
 
 		 401 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  84.71 
 
 		 399 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.75 
 
 		 401 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 		 399 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.44 
 
 		 400 aa  631  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.19 
 
 		 400 aa  628  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.3 
 
 		 401 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.25 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77 
 
 		 400 aa  624  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.31 
 
 		 401 aa  622  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.3 
 
 		 401 aa  611  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.75 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  587  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.75 
 
 		 400 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.5 
 
 		 405 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.75 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.25 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.75 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.5 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.5 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.25 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.5 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72 
 
 		 400 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.5 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.5 
 
 		 402 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.93 
 
 		 402 aa  568  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.5 
 
 		 401 aa  569  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.25 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.75 
 
 		 400 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 		 400 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.75 
 
 		 400 aa  566  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73 
 
 		 406 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.43 
 
 		 401 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.5 
 
 		 400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  70.25 
 
 		 401 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.5 
 
 		 400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.5 
 
 		 400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.75 
 
 		 400 aa  558  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69 
 
 		 400 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  69 
 
 		 400 aa  555  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71 
 
 		 400 aa  557  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71 
 
 		 400 aa  554  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.25 
 
 		 400 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.08 
 
 		 402 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.5 
 
 		 400 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.83 
 
 		 402 aa  552  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 		 400 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  68.25 
 
 		 399 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.25 
 
 		 399 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.57 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.48 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.92 
 
 		 405 aa  548  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 		 400 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  73.48 
 
 		 401 aa  549  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.67 
 
 		 401 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.41 
 
 		 404 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.33 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.58 
 
 		 401 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  71.07 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.08 
 
 		 401 aa  544  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.33 
 
 		 402 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.75 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 		 400 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.08 
 
 		 406 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68 
 
 		 399 aa  536  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.75 
 
 		 400 aa  537  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.93 
 
 		 403 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.08 
 
 		 401 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.58 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.83 
 
 		 404 aa  532  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.42 
 
 		 401 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  66.58 
 
 		 401 aa  528  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.16 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  65.34 
 
 		 401 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.92 
 
 		 406 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.57 
 
 		 406 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.67 
 
 		 401 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1377  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.83 
 
 		 400 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388007  normal  0.268922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.67 
 
 		 406 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.25 
 
 		 400 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.08 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.58 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.58 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>