More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_5005 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21600  aliphatic sulfonates ABC transporter, inner membrane component  57.09 
 
 
284 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.89 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.840444  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  56.3 
 
 
277 aa  281  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.77 
 
 
273 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3598  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.43 
 
 
285 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1796  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  57.64 
 
 
285 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.96 
 
 
280 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.79 
 
 
272 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0102858  normal  0.0961586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.83 
 
 
269 aa  248  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.14 
 
 
266 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.46 
 
 
265 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.63 
 
 
265 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.63 
 
 
265 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.63 
 
 
265 aa  244  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.21 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.29 
 
 
264 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  48.75 
 
 
263 aa  242  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  49.37 
 
 
262 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.45 
 
 
297 aa  241  9e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
264 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
264 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  48.95 
 
 
262 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.57 
 
 
263 aa  238  5.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
278 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.65 
 
 
280 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.13 
 
 
275 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.54 
 
 
260 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 
271 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4139  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.36 
 
 
275 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000314222  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.67 
 
 
291 aa  235  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  48.12 
 
 
264 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.12 
 
 
264 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3159  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
293 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.85 
 
 
315 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2583  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
289 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
289 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
289 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753313  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  47.72 
 
 
286 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.72 
 
 
286 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.69 
 
 
272 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2979  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.89 
 
 
296 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5315  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 
265 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0765  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
265 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  45.75 
 
 
279 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 
279 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.95 
 
 
264 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.154719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4875  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.37 
 
 
265 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746085  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  45.34 
 
 
279 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.18 
 
 
294 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.136656  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.54 
 
 
268 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2492  ABC aliphatic sulfonates transporter, innermembrane subunit  47.72 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.773133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
272 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00938  alkanesulfonate transporter subunit  48.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.028081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.753275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00945  hypothetical protein  48.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1043  alkanesulfonate transporter permease subunit  48.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2662  alkanesulfonate transporter permease subunit  48.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.629834  normal  0.0100847 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1036  alkanesulfonate transporter permease subunit  48.41 
 
 
263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0685931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.37 
 
 
292 aa  219  5e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.780897  normal  0.0430449 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.21 
 
 
284 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1096  alkanesulfonate transporter permease subunit  48.41 
 
 
263 aa  218  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00432775  normal  0.422148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.61 
 
 
280 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2185  alkanesulfonate transporter permease subunit  48.41 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11182  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1867  ABC transporter permease  48.75 
 
 
272 aa  216  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
294 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0683  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.79 
 
 
268 aa  215  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.473028  normal  0.58692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.57 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.75 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.5369  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
260 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.63 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0616622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.79 
 
 
300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0833403  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30490  aliphatic sulfonate ABC transporter permease protein  48.12 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.168678  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.150226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.52 
 
 
272 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.88893  normal  0.0504928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
283 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
283 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258867  hitchhiker  0.00000636426 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
270 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0890555  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
270 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
270 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.11 
 
 
259 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00307443  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
268 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
283 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189471  normal  0.0804385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4705  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  45.19 
 
 
270 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.19 
 
 
270 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0183453  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
281 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1822  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 
269 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1837  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  46.41 
 
 
269 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  42.31 
 
 
282 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  42.31 
 
 
282 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2500  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  45.61 
 
 
268 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1975  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.64 
 
 
267 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1238  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 
273 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0780  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 
273 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1990  aliphatic sulfonates ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 
273 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.088895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1724  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 
273 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0381  aliphatic sulfonate ABC transporter, permease protein  45.99 
 
 
273 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.410212  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.77 
 
 
270 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.35 
 
 
262 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>