More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4894 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 397 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  62.04 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 387 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  34.63 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  35.09 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 500 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 492 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 378 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  31.97 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  33.42 
 
 		 375 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  30.25 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.18 
 
 		 376 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 390 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 389 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 375 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.67 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 442 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  26.09 
 
 		 446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  30.4 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 392 aa  120  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  28.65 
 
 		 377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  26.62 
 
 		 443 aa  116  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  27.82 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3289  sarcosine oxidase beta subunit family protein  29.31 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1141  sarcosine oxidase beta subunit family protein  30.21 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3120  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7233  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.5 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0553602 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0512  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.29 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1949  sarcosine oxidase, beta subunit  28.1 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.572623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1344  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.18 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0947006  normal  0.025984 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2686  putative sarcosine oxidase beta subunit  27.18 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0604356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.69 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4909  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.86 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.315195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  32.02 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0969  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.04 
 
 		 431 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1577  sarcosine oxidase, beta subunit family  28.1 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2104  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1877  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.3 
 
 		 415 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 983 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1936  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.9 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2636  sarcosine oxidase, beta subunit family  27.55 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1654  sarcosine oxidase beta subunit family protein  27.35 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.502295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2183  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.33 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.409819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 		 382 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3472  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  29.15 
 
 		 375 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  24.83 
 
 		 444 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 441 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  27.09 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 984 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2452  sarcosine oxidase, beta subunit  26.65 
 
 		 413 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00527323  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5746  sarcosine oxidase beta subunit  25 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.267033  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3375  sarcosine oxidase beta subunit family protein  26.99 
 
 		 416 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>