204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4892 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 		 441 aa  876    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2252  MmgE/PrpD family protein  55.53 
 
 		 456 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  47.53 
 
 		 453 aa  391  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2358  MmgE/PrpD  50.46 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3057  MmgE/PrpD family protein  41 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 		 467 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5500  MmgE/PrpD family protein  30.62 
 
 		 453 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.168199  normal  0.788577 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8184  MmgE/PrpD family protein  29.51 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.825768  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8168  hypothetical protein  31.24 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  27.23 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  29.67 
 
 		 451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2474  MmgE/PrpD family protein  32.62 
 
 		 444 aa  128  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288716  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  29.93 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.4 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1089  MmgE/PrpD family protein  29.25 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1843  MmgE/PrpD family protein  30.26 
 
 		 449 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.279739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  29.31 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  29.96 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  30.05 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  28.34 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  28.53 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7496  MmgE/PrpD family protein  26.88 
 
 		 469 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000196116  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  25.69 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  29.13 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  31.84 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  25.38 
 
 		 469 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  30.95 
 
 		 447 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  31.28 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  29.72 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  29.17 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  28.19 
 
 		 449 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  30.09 
 
 		 461 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  28.85 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  29.62 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  30.37 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  30.02 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1088  MmgE/PrpD family protein  29.04 
 
 		 472 aa  103  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3409  MmgE/PrpD family protein  28.89 
 
 		 455 aa  103  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  26.59 
 
 		 463 aa  103  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  29.48 
 
 		 458 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0572  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0357  MmgE/PrpD  29.78 
 
 		 454 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  28.75 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  30.11 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  28.12 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  27.17 
 
 		 470 aa  100  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  29.23 
 
 		 455 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 458 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  27.03 
 
 		 450 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  27.39 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  26.79 
 
 		 450 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  20.75 
 
 		 446 aa  97.4  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  21.41 
 
 		 446 aa  97.1  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  27.44 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  28.07 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  26.15 
 
 		 450 aa  94.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.05 
 
 		 485 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  28.7 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  26.65 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  23.72 
 
 		 449 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  23.95 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  30.03 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  27.99 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  29.03 
 
 		 463 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  29.03 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  29.01 
 
 		 453 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  29.62 
 
 		 503 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  29.62 
 
 		 503 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  22.4 
 
 		 449 aa  90.1  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  27.51 
 
 		 472 aa  89.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4385  MmgE/PrpD family protein  29.59 
 
 		 521 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  25.88 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  34.01 
 
 		 477 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4133  2-methylcitrate dehydratase  27.57 
 
 		 485 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.598985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  27.15 
 
 		 458 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  26.7 
 
 		 481 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  27.5 
 
 		 451 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  26.59 
 
 		 457 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.73 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  25.55 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  27.54 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1723  hypothetical protein  26.46 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0116764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6460  MmgE/PrpD family protein  24.46 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00728409  normal  0.371072 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  26.17 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  26.65 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  28.05 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  26.75 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  25.72 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  28.75 
 
 		 476 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2237  MmgE/PrpD family protein  25 
 
 		 487 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  29.4 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  20.73 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  28.23 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  24.4 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0278  2-methylcitrate dehydratase  26.03 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.914364  normal  0.0835983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  27.03 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3042  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2918  MmgE/PrpD family protein  24.94 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>