More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4871 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 268 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.35 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.24 
 
 		 273 aa  238  9e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.73 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.29 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  54.51 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.93 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.76 
 
 		 269 aa  202  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.31 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.86 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.77 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.37 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.4 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.46 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.27 
 
 		 278 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.61 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.24 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.12 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.92 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.54 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.45 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.7 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.76 
 
 		 275 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.35 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.64 
 
 		 274 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.79 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  47.74 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 272 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 273 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.89 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.29 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.28 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.36 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.56 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.63 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.49 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.91 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.91 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.77 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.66 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.21 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0955  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00507177  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.2 
 
 		 293 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.38 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.82 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3816  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.49 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2668  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.55 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.05 
 
 		 271 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.21 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6743  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.32 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 271 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2508  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.89 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3002  Delta 1-pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1287  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.11 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00333  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3246  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0855673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0413  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.47 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0454  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 270 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00337  hypothetical protein  39.25 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>