78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4854 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1131    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  70.68 
 
 		 563 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  48.52 
 
 		 580 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  45.86 
 
 		 580 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  47.9 
 
 		 580 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  45.71 
 
 		 576 aa  456  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  38.2 
 
 		 652 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0008  hypothetical protein  38.74 
 
 		 419 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1424  aconitase subunit 1  40.48 
 
 		 415 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0316899  normal  0.0572647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2340  aconitase subunit 1  40.38 
 
 		 415 aa  250  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3764  hypothetical protein  41.11 
 
 		 415 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283773  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3759  hypothetical protein  41.11 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0137498  normal  0.225559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4604  hypothetical protein  41.11 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4971  hypothetical protein  41.59 
 
 		 415 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5490  hypothetical protein  39.9 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3636  hypothetical protein  39.66 
 
 		 415 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2556  hypothetical protein  39.08 
 
 		 418 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000806636  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2437  hypothetical protein  33.75 
 
 		 389 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.382594 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0796  hypothetical protein  34.68 
 
 		 393 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0207  hypothetical protein  33.42 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0123  hypothetical protein  33.42 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.476328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0935  hypothetical protein  29.25 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.196972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2138  hypothetical protein  31.58 
 
 		 386 aa  187  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0963  hypothetical protein  29.5 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.609642  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1036  hypothetical protein  27.68 
 
 		 415 aa  181  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0511  protein of unknown function DUF521  29.97 
 
 		 387 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0849  protein of unknown function DUF521  32.89 
 
 		 386 aa  177  3e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1472  aconitase subunit 1  31.76 
 
 		 395 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0717  aconitase subunit 1  31.25 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0056  aconitase subunit 1  30.71 
 
 		 394 aa  171  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00973129 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6224  hypothetical protein  32.34 
 
 		 428 aa  170  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1010  hypothetical protein  29.5 
 
 		 401 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0690809  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6626  hypothetical protein  32.34 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6393  hypothetical protein  32.34 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1745  aconitase subunit 1  29.25 
 
 		 401 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0813314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0616  predicted aconitase subunit 1  31.7 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.564704  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3213  protein of unknown function DUF521  29.43 
 
 		 431 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1693  hypothetical protein  26.5 
 
 		 599 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0053  hypothetical protein  28.79 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4969  hypothetical protein  29.23 
 
 		 409 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0991  hypothetical protein  26.03 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  50.45 
 
 		 155 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  40.17 
 
 		 149 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  40.17 
 
 		 149 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  38.81 
 
 		 154 aa  97.1  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  39.55 
 
 		 159 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  40.17 
 
 		 159 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  37.78 
 
 		 152 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2207  hypothetical protein  24.88 
 
 		 422 aa  94  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.352777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  39.32 
 
 		 159 aa  93.6  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1920  hypothetical protein  31.85 
 
 		 373 aa  93.2  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  47.92 
 
 		 132 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  46.94 
 
 		 131 aa  88.6  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  41.84 
 
 		 147 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  42.42 
 
 		 166 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  36.13 
 
 		 150 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  42.27 
 
 		 130 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  41.76 
 
 		 136 aa  82  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  43.88 
 
 		 146 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0855  hypothetical protein  27.68 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  44.21 
 
 		 142 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0949  aconitase subunit 1  27.72 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  38.78 
 
 		 138 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1398  hypothetical protein  27.69 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.492056  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  36.08 
 
 		 150 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  38.04 
 
 		 137 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  33.67 
 
 		 154 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  33.67 
 
 		 154 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  33.67 
 
 		 154 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  34.41 
 
 		 131 aa  54.3  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  32.29 
 
 		 130 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0848  protein of unknown function DUF126  29.59 
 
 		 120 aa  50.4  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  30.77 
 
 		 128 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  32.97 
 
 		 130 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  32.97 
 
 		 130 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  30.34 
 
 		 126 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2206  hypothetical protein  37.31 
 
 		 147 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>