103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4774 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4774  phosphonate metabolism protein PhnM  100 
 
 		 380 aa  757    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.807086  normal  0.597497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  66.84 
 
 		 380 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3695  phosphonate metabolism PhnM  65.08 
 
 		 380 aa  486  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2853  phosphonate metabolism PhnM  63.47 
 
 		 434 aa  455  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2963  phosphonate metabolism protein PhnM  46.89 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.513647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5842  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  48.44 
 
 		 385 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1310  phosphonate metabolism protein PhnM  47.52 
 
 		 379 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.210169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3850  phosphonate metabolism protein PhnM  50 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.739872 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6092  phosphonate metabolism protein PhnM  46.72 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  44.97 
 
 		 374 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  44.68 
 
 		 383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0663819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2189  phosphonate metabolism protein PhnM  45.14 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.300882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4112  phosphonate metabolism protein PhnM  44.18 
 
 		 374 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3661  phosphonate metabolism protein PhnM  45.81 
 
 		 379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.902619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2880  phosphonate metabolism protein PhnM  44.53 
 
 		 381 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4213  phosphonate metabolism protein PhnM  51.04 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0756  phosphonate metabolism protein PhnM  48.43 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0287  phosphonate metabolism protein PhnM  44.94 
 
 		 383 aa  302  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5608  phosphonate metabolism protein PhnM  43.92 
 
 		 378 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4663  phosphonate metabolism protein PhnM  43.42 
 
 		 379 aa  301  9e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00935004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2908  phosphonate metabolism protein PhnM  51.82 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.579658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4095  phosphonate metabolism PhnM  47.52 
 
 		 384 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0403567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2366  phosphonate metabolism protein PhnM  43.31 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4561  phosphonate metabolism protein PhnM  43.92 
 
 		 378 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3931  phosphonate metabolism protein PhnM  43.65 
 
 		 378 aa  299  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3831  phosphonate metabolism PhnM  47.26 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.597425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4336  phosphonate metabolism protein PhnM  43.65 
 
 		 378 aa  298  9e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1280  phosphonate metabolism PhnM  47.92 
 
 		 384 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0119955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2257  amidohydrolase  42.26 
 
 		 381 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.208452  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0299  phosphonate metabolism protein PhnM  43.12 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3896  phosphonate metabolism protein PhnM  43.12 
 
 		 378 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0860  PhnM protein  43.57 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0853  phosphonate metabolism protein PhnM  43.57 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03967  carbon-phosphorus lyase complex subunit  43.12 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4649  phosphonate metabolism protein PhnM  43.39 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03927  hypothetical protein  43.12 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2565  phosphonate metabolism protein PhnM  41.99 
 
 		 381 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1755  phosphonate metabolism protein PhnM  45.34 
 
 		 387 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.119299  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20430  phosphonate metabolism protein  45.08 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119853  normal  0.758081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2688  phosphonate metabolism protein PhnM  41.73 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2185  putative phosphonate metabolism protein PhnM  41.73 
 
 		 377 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377971  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5946  phosphonate metabolism protein PhnM  41.99 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  42.26 
 
 		 380 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0139  phosphonate metabolism PhnM  40.58 
 
 		 380 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0893  phosphonate metabolism protein PhnM  41.53 
 
 		 378 aa  275  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291146  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3334  amidohydrolase-like  40.31 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3779  phosphonate metabolism protein PhnM  42.02 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.714138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1314  phosphonate metabolism protein PhnM  42.06 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4025  PhnM protein  41.53 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3700  phosphonate metabolism protein PhnM  41.53 
 
 		 378 aa  272  6e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3566  phosphonate metabolism protein PhnM  41.53 
 
 		 378 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1037  amidohydrolase  43.42 
 
 		 380 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0515  phosphonate metabolism protein PhnM  39.15 
 
 		 378 aa  268  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3351  phosphonate metabolism protein PhnM  43.42 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3339  phosphonate metabolism protein PhnM  43.42 
 
 		 377 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2406  alkylphosphonate utilization operon protein PhnM  43.68 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.854839  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1183  phosphonate metabolism protein PhnM  43.68 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3305  phosphonate metabolism protein PhnM  43.68 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2592  phosphonate metabolism protein PhnM  43.68 
 
 		 377 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0322  phosphonate metabolism protein PhnM  43.42 
 
 		 377 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0826  phosphonate metabolism protein PhnM  40.52 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0583622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0581  phosphonate metabolism protein PhnM  40.21 
 
 		 378 aa  256  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0485  phosphonate metabolism protein PhnM  40.21 
 
 		 378 aa  256  6e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2917  phosphonate metabolism protein PhnM  42.3 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0015  amidohydrolase 3  42.38 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0974182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1931  phosphonate metabolism protein PhnM  37.89 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.042135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2284  phnM protein, putative  37.89 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0628969  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3883  phosphonate metabolism protein PhnM  38.28 
 
 		 388 aa  242  7.999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  33.07 
 
 		 387 aa  205  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  33.51 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4043  amidohydrolase 3  35.77 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0223  amidohydrolase 3  35.77 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1093  phosphonate metabolism protein PhnM  35.62 
 
 		 389 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255627  hitchhiker  0.00301436 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0430  phosphonate metabolism protein  37.26 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0466  phosphonate metabolism protein  37.26 
 
 		 399 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4192  amidohydrolase:amidohydrolase-like  34.97 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1239  phosphonate metabolism protein PhnM  35.62 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.788895  hitchhiker  0.000230339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0760  amidohydrolase 3  36.43 
 
 		 408 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00298442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0233  amidohydrolase  38.61 
 
 		 452 aa  188  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2290  amidohydrolase-like protein  33.25 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5003  phosphonate metabolism protein PhnM  32.82 
 
 		 382 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.849449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3506  amidohydrolase  34.9 
 
 		 406 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3905  Amidohydrolase 3  31.87 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.955259  normal  0.347183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3856  Amidohydrolase 3  31.61 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0507  Amidohydrolase 3  34.63 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1585  phosphonate metabolism protein PhnM  34.11 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4082  phosphonate metabolism PhnM  32.97 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.123064  normal  0.0758016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3818  phosphonate metabolism PhnM  32.88 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00668671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2288  amidohydrolase 3  31.89 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4150  amidohydrolase 3  31.89 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0494  Amidohydrolase 3  34.8 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.229543 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0770  phosphonate metabolism protein PhnM  31.15 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4434  phosphonate metabolism PhnM  33.43 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4184  amidohydrolase:amidohydrolase-like  34.27 
 
 		 408 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.767243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0768  amidohydrolase 3  34.55 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2157  metal-dependent hydrolase  36.51 
 
 		 589 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5860  putative metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism  30.75 
 
 		 395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.323528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0602  amidohydrolase 3  34.87 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188787  normal  0.301393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2917  hypothetical protein  37.09 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3357  alkylphosphonate utilization protein PhnM, putative  34.65 
 
 		 380 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>