More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4634 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4634  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
492 aa  980    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00269371  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  37.72 
 
 
496 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0802  leucyl aminopeptidase  36.21 
 
 
511 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.515855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3221  leucyl aminopeptidase  36.21 
 
 
511 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3443  Leucyl aminopeptidase  35.14 
 
 
510 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3637  leucyl aminopeptidase  35.14 
 
 
510 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  38.66 
 
 
496 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3324  peptidase M17, leucyl aminopeptidase domain-containing protein  36.21 
 
 
511 aa  263  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0850  leucyl aminopeptidase  34.92 
 
 
510 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3514  leucyl aminopeptidase  34.92 
 
 
510 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0897  leucyl aminopeptidase  35.14 
 
 
518 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0959  cytosol aminopeptidase  36.21 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  36.54 
 
 
497 aa  259  8e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  35.9 
 
 
497 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2600  leucyl aminopeptidase  36.18 
 
 
498 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0616  leucyl aminopeptidase  35.06 
 
 
508 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.294283 
 
 
-
 
NC_002978  WD0054  leucyl aminopeptidase  33.55 
 
 
500 aa  253  8.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0766  leucyl aminopeptidase  36.29 
 
 
497 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.133463 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0475  cytosol aminopeptidase  43.26 
 
 
506 aa  252  1e-65  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00320613  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0369  leucyl aminopeptidase  33.4 
 
 
500 aa  249  6e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0642  leucyl aminopeptidase  32.77 
 
 
500 aa  246  6e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1545  leucyl aminopeptidase  38 
 
 
497 aa  246  9e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.87214  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  37.28 
 
 
487 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  36.43 
 
 
492 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1756  leucyl aminopeptidase  37.24 
 
 
495 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.09073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  34.07 
 
 
498 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3937  Leucyl aminopeptidase  38.24 
 
 
497 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0971426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  40.8 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3944  Leucyl aminopeptidase  38.01 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0454  leucyl aminopeptidase  35.45 
 
 
500 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3470  leucyl aminopeptidase  34.12 
 
 
500 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.987898  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3651  leucyl aminopeptidase  37.56 
 
 
497 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2531  leucyl aminopeptidase  35.89 
 
 
493 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.353426  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2847  Leucyl aminopeptidase  40.16 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154644  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2314  leucyl aminopeptidase  35.23 
 
 
499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1204  leucyl aminopeptidase  41.03 
 
 
514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.453819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3832  leucyl aminopeptidase  36.42 
 
 
499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.454822 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17591  leucyl aminopeptidase  33.41 
 
 
495 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.697239  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3765  Leucyl aminopeptidase  37.74 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0903  leucyl aminopeptidase  36.08 
 
 
495 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2108  leucyl aminopeptidase  36.44 
 
 
489 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3337  leucyl aminopeptidase  34.33 
 
 
497 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.39658 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1227  leucyl aminopeptidase  37.26 
 
 
494 aa  232  9e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.494822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0557  leucyl aminopeptidase  35.43 
 
 
503 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0287473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2481  leucyl aminopeptidase  34.92 
 
 
500 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1761  leucyl aminopeptidase  35.65 
 
 
481 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  37.87 
 
 
511 aa  230  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0650  leucyl aminopeptidase  38.38 
 
 
542 aa  229  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2824  leucyl aminopeptidase  29.47 
 
 
493 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2510  leucyl aminopeptidase  36.64 
 
 
493 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2727  leucyl aminopeptidase  41.12 
 
 
491 aa  228  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2221  Leucyl aminopeptidase  41.77 
 
 
539 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.258541 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1430  leucyl aminopeptidase  39.23 
 
 
490 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2996  leucyl aminopeptidase  32.4 
 
 
515 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.143119 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15321  leucyl aminopeptidase  38.15 
 
 
490 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2339  leucyl aminopeptidase  40.68 
 
 
500 aa  226  8e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13861  leucyl aminopeptidase  37.17 
 
 
493 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0993846  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1122  leucyl aminopeptidase  38.99 
 
 
489 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.289699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4642  Leucyl aminopeptidase  39.06 
 
 
480 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15181  leucyl aminopeptidase  37.86 
 
 
490 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0412  leucyl aminopeptidase  40.06 
 
 
489 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0249677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2965  leucyl aminopeptidase  41.27 
 
 
500 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.434941  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1676  leucyl aminopeptidase  41.38 
 
 
500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.933774  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  38.73 
 
 
497 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4525  Leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
491 aa  223  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0561  leucyl aminopeptidase  39.72 
 
 
490 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2878  leucyl aminopeptidase  39.34 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1191  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.239585  normal  0.359971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1921  PepA aminopeptidase  42.14 
 
 
496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428802  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1411  leucyl aminopeptidase  40.43 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0436782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  41.69 
 
 
487 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1725  Leucyl aminopeptidase  42.14 
 
 
496 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1815  leucyl aminopeptidase  40.61 
 
 
488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.453666 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2018  leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 
490 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0069  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 
496 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  41.81 
 
 
488 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  41.1 
 
 
495 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5835  peptidase M17 leucyl aminopeptidase domain protein  35.07 
 
 
500 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0999  leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 
511 aa  218  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0315  leucyl aminopeptidase  35.43 
 
 
499 aa  216  5e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  33.83 
 
 
501 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2116  leucyl aminopeptidase  38.79 
 
 
479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0388  leucyl aminopeptidase  33.33 
 
 
510 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00389759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14931  leucyl aminopeptidase  35.25 
 
 
495 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3363  Leucyl aminopeptidase  33.24 
 
 
471 aa  216  9e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  34.79 
 
 
496 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  35.85 
 
 
500 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3162  PepA aminopeptidase  40.5 
 
 
528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  30.57 
 
 
488 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0880  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 
616 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  38.38 
 
 
497 aa  211  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1125  Leucyl aminopeptidase  30.52 
 
 
491 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.013782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0890  leucyl aminopeptidase  36.84 
 
 
485 aa  210  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.119935  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  35.08 
 
 
486 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3023  leucyl aminopeptidase  39.39 
 
 
502 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5097  leucyl aminopeptidase  37.27 
 
 
500 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803796  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  36.93 
 
 
492 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0950  leucyl aminopeptidase  38.37 
 
 
491 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.111685  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05571  leucyl aminopeptidase  39.89 
 
 
506 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>