More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4631 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  100 
 
 		 460 aa  899    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 465 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 467 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 467 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 470 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  30.94 
 
 		 475 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 454 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 450 aa  160  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  30.22 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  30.22 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 426 aa  143  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 440 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 433 aa  136  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4086  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0463716  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 456 aa  134  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 461 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 459 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  32 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 457 aa  126  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 454 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4352  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  28.5 
 
 		 440 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 438 aa  117  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 578 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 542 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 448 aa  113  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2369  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 447 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0795  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 484 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 443 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 472 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  29.11 
 
 		 449 aa  106  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 506 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6228  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 450 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  33.56 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1677  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3636  major facilitator transporter  33.45 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 438 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  33.11 
 
 		 471 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 450 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 442 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  38.62 
 
 		 198 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 416 aa  97.8  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 448 aa  97.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0620  major facilitator superfamily MFS_1  32.19 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0287164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0609  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.11998 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 457 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  25.17 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 435 aa  90.5  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 530 aa  90.1  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 418 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 426 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 442 aa  86.7  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4141  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 850 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0685  major facilitator transporter  30.82 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 426 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>