More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4529 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  100 
 
 		 525 aa  1046    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  29.47 
 
 		 492 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  28.71 
 
 		 483 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  29.22 
 
 		 482 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  27.81 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  28.63 
 
 		 481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  28.37 
 
 		 495 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  28.02 
 
 		 493 aa  123  7e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  28.66 
 
 		 491 aa  123  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  29.81 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  29.81 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  29.81 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  28.71 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  29.23 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  29.81 
 
 		 483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  28.24 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  28.24 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  28.24 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  28.13 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  28.13 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  28.09 
 
 		 494 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  28.13 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  28.13 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  27.22 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  28.13 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  29.19 
 
 		 477 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.79 
 
 		 497 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  27.25 
 
 		 483 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  25.22 
 
 		 480 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1542  sodium/proline symporter  27.66 
 
 		 502 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.13082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0148  sodium/proline symporter  26.8 
 
 		 499 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.720955  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  26.73 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  28.21 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  28.91 
 
 		 477 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.66 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  27.96 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4995  sodium/proline symporter  26.76 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  28.94 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  29.11 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  28.47 
 
 		 477 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  26.84 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  29.67 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4818  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.88778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  28.24 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.57 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  27.27 
 
 		 492 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  27.22 
 
 		 483 aa  117  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.67 
 
 		 489 aa  117  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.98 
 
 		 493 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4946  sodium/proline symporter  26.85 
 
 		 492 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3766  sodium/proline symporter  25.58 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.525061  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  26.35 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  27.7 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  27.07 
 
 		 481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.65 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  26.22 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  29.15 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  27.2 
 
 		 496 aa  114  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.67 
 
 		 518 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  26.48 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.84 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.84 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.47 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  29.54 
 
 		 498 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.84 
 
 		 492 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.84 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  26.88 
 
 		 483 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  28.12 
 
 		 484 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1575  Sodium/proline symporter  29.75 
 
 		 498 aa  111  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0675536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  27.02 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.96 
 
 		 493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  27.76 
 
 		 483 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  26.32 
 
 		 492 aa  110  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05510  SSS sodium solute transporter  27.41 
 
 		 536 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.81 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.81 
 
 		 493 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  25.7 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  26.68 
 
 		 483 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2108  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 502 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.275652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01018  proline:sodium symporter  26.09 
 
 		 502 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1131  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 502 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1135  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 502 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0465761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2580  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 502 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0213742 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2627  sodium/proline symporter  26.09 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.84 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  25.7 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  27.37 
 
 		 493 aa  109  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  26.87 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>