More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4510 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  68.76 
 
 
509 aa  695    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  69.57 
 
 
509 aa  702    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  69.88 
 
 
493 aa  677    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  69.4 
 
 
509 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
511 aa  1015    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  67.73 
 
 
508 aa  681    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  70.49 
 
 
509 aa  709    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.63 
 
 
520 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.29 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.29 
 
 
521 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.49 
 
 
524 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.95 
 
 
525 aa  434  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.88 
 
 
534 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  53.41 
 
 
527 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.2 
 
 
517 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.41 
 
 
527 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.93 
 
 
523 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  54.5 
 
 
517 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.16 
 
 
520 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  55.94 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.07 
 
 
524 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.58 
 
 
524 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.68 
 
 
527 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50 
 
 
526 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.36 
 
 
529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.26 
 
 
527 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  49.89 
 
 
524 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  56.01 
 
 
518 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  53.9 
 
 
525 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  52.05 
 
 
522 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.11 
 
 
524 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.36 
 
 
524 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  45.29 
 
 
519 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.92 
 
 
523 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  50.56 
 
 
510 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.76 
 
 
514 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.63 
 
 
530 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  51.8 
 
 
512 aa  341  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.71 
 
 
553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  42.57 
 
 
476 aa  337  3.9999999999999995e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.8 
 
 
519 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.48 
 
 
500 aa  330  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  44.19 
 
 
542 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.8 
 
 
522 aa  328  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.94 
 
 
514 aa  327  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.39 
 
 
509 aa  323  5e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.32 
 
 
506 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.87 
 
 
558 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.42 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5458  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.49 
 
 
521 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.245549  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.42 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.42 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.64 
 
 
525 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.42 
 
 
549 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.53 
 
 
522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0570  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.6 
 
 
525 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438244  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.41 
 
 
525 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.78 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.39 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2756  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.29 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626039  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6056  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.21 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2117  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.29 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2729  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.29 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.78 
 
 
561 aa  313  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  37.8 
 
 
549 aa  312  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.01 
 
 
549 aa  312  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.73 
 
 
553 aa  311  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.58 
 
 
521 aa  312  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2780  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.58 
 
 
525 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.24 
 
 
521 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.77 
 
 
525 aa  310  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2647  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.36 
 
 
525 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.79 
 
 
549 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.87 
 
 
533 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.42 
 
 
549 aa  310  5e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.24 
 
 
521 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.02 
 
 
517 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.79 
 
 
549 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.58 
 
 
549 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.49 
 
 
544 aa  309  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0652  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.32 
 
 
525 aa  309  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.559631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.87 
 
 
533 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.93 
 
 
504 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.32 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37 
 
 
549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  41.46 
 
 
480 aa  307  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.52 
 
 
547 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.1 
 
 
545 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.36 
 
 
551 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.68 
 
 
527 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1321  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.17 
 
 
521 aa  306  7e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0459359  normal  0.0103922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.47 
 
 
527 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.87 
 
 
525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.28 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>