163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4467 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4467  dihydroorotase  100 
 
 		 347 aa  704    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.506295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  73.78 
 
 		 346 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  72.75 
 
 		 346 aa  510  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  73.12 
 
 		 346 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  73.41 
 
 		 346 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  72.01 
 
 		 345 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1475  dihydroorotase  68.7 
 
 		 346 aa  484  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623484  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  66.57 
 
 		 350 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  67.06 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  66.47 
 
 		 348 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1742  dihydroorotase  65.71 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.119262  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0106  dihydroorotase  65.31 
 
 		 347 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  60.69 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  59.54 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  59.54 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  59.54 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  59.83 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  59.54 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  59.54 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  59.54 
 
 		 378 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  58.89 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  53.67 
 
 		 347 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  58.89 
 
 		 344 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  57.97 
 
 		 354 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  57.06 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  57.97 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  57.97 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  57.97 
 
 		 364 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  58.02 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  57.97 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  56.77 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  58.26 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  58.02 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  57.43 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  52.89 
 
 		 355 aa  378  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  56.73 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  57.1 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  55.65 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  55.75 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  55.65 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  53.96 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  55.87 
 
 		 347 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  55.65 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  58.02 
 
 		 343 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  56.85 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  55.1 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  57.14 
 
 		 364 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  56.36 
 
 		 343 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  55.07 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  54.36 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  54.65 
 
 		 366 aa  368  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  53.62 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  53.37 
 
 		 347 aa  368  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  54.34 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  54.2 
 
 		 343 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  55.65 
 
 		 348 aa  368  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  55.07 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  58.23 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  54.78 
 
 		 348 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  53.62 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  53.62 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  53.62 
 
 		 347 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  55.69 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  56.89 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  54.57 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  55.94 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  52.91 
 
 		 348 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  52.91 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  56.23 
 
 		 346 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  55.07 
 
 		 348 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  52.91 
 
 		 348 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  53.76 
 
 		 343 aa  360  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  55.26 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  52.49 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  53.62 
 
 		 343 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  53.06 
 
 		 342 aa  358  6e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  53.8 
 
 		 344 aa  358  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  53.62 
 
 		 343 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5321  dihydroorotase  57.51 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  54.73 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  51.01 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  53.33 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  55.69 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  50.72 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  57.14 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  53.04 
 
 		 343 aa  355  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  52.75 
 
 		 345 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  54.97 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  56.19 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  53.62 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  56.65 
 
 		 340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  52.17 
 
 		 345 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  53.91 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  51.85 
 
 		 354 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  51.16 
 
 		 348 aa  351  8e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  53.6 
 
 		 345 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  53.47 
 
 		 343 aa  351  8.999999999999999e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  51.57 
 
 		 354 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  55.45 
 
 		 342 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  56.38 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>