189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4456 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
250 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  72.4 
 
 
226 aa  344  8e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  71.6 
 
 
226 aa  343  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  69.6 
 
 
226 aa  341  8e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  58.78 
 
 
234 aa  275  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  59.44 
 
 
233 aa  274  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  55.6 
 
 
242 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  55.6 
 
 
242 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  58.09 
 
 
235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  58.61 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3061  MOSC domain-containing protein  52.42 
 
 
243 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068485  normal  0.778276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4660  MOSC domain containing protein  57.63 
 
 
220 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.287736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4809  MOSC domain containing protein  58.51 
 
 
227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.359001 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  54.66 
 
 
237 aa  235  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1959  MOSC domain-containing protein  51.03 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0955  MOSC domain-containing protein  51.03 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0870  MOSC domain-containing protein  51.03 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0278  MOSC domain-containing protein  51.03 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0356222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1005  MOSC domain-containing protein  51.03 
 
 
229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1159  MOSC domain-containing protein  50.83 
 
 
229 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0802  MOSC domain-containing protein  50.62 
 
 
235 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0998  MOSC domain-containing protein  50.62 
 
 
229 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.759805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  51.85 
 
 
235 aa  228  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  51.02 
 
 
241 aa  226  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  50.21 
 
 
235 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  50.42 
 
 
234 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  50.62 
 
 
241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  53.47 
 
 
239 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  49.17 
 
 
234 aa  221  7e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  49.17 
 
 
234 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  48.75 
 
 
234 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  48.75 
 
 
234 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  47.76 
 
 
234 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  46.94 
 
 
234 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0651  hypothetical protein  47.11 
 
 
233 aa  211  9e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  45.27 
 
 
242 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2076  hypothetical protein  41.98 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0210  MOSC domain containing protein  44.26 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001034  hypothetical protein  41.15 
 
 
230 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.907247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0630  hypothetical protein  43.04 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  43.48 
 
 
233 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0036  MOSC  41.28 
 
 
234 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  45.49 
 
 
228 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1701  MOSC domain-containing protein  43.24 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4906  MOSC domain-containing protein  34.85 
 
 
227 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1485  hypothetical protein  38.02 
 
 
232 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0104541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5365  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  156  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326759  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  43.58 
 
 
220 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4303  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.445001  hitchhiker  0.00595644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03796  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4074  MOSC domain containing protein  39.36 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03745  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4107  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4141  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4444  hypothetical protein  39.36 
 
 
224 aa  155  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0079  hypothetical protein  39.27 
 
 
223 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4390  hypothetical protein  38.96 
 
 
224 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  37.12 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4062  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00109067  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2475  MOSC domain containing protein  38.46 
 
 
215 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4454  hypothetical protein  36.33 
 
 
229 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4386  hypothetical protein  36.33 
 
 
229 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4273  hypothetical protein  36.63 
 
 
229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.833084 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4302  hypothetical protein  36.33 
 
 
229 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4342  hypothetical protein  36.63 
 
 
229 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000280654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3657  MOSC domain containing protein  38.99 
 
 
221 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  40.16 
 
 
229 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0273  MOSC domain-containing protein  36.68 
 
 
231 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0281  MOSC domain-containing protein  36.68 
 
 
231 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0277  MOSC domain containing protein  36.68 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4456  hypothetical protein  35.37 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3752  MOSC domain-containing protein  36.09 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0280  MOSC domain-containing protein  36.09 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.077384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0270  MOSC domain-containing protein  35.65 
 
 
231 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112146  hitchhiker  0.00000109327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0269  MOSC domain-containing protein  35.65 
 
 
231 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.480151  hitchhiker  0.0000407513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4123  MOSC domain-containing protein  34.5 
 
 
232 aa  138  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1855  mosc domain-containing protein  37.67 
 
 
229 aa  138  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0385  MOSC domain-containing protein  35.53 
 
 
231 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4406  MOSC domain-containing protein  34.65 
 
 
232 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0712401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0083  MOSC domain-containing protein  35.96 
 
 
230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0145195  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  34.06 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  34.21 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  34.21 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  33.77 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  34.21 
 
 
228 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  31.22 
 
 
222 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3877  MOSC  34.58 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.913671  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0078  MOSC domain-containing protein  32.47 
 
 
230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  33.04 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2166  MOSC domain containing protein  33.82 
 
 
212 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00996581  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0963  MOSC domain-containing protein  34.5 
 
 
221 aa  123  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2362  MOSC domain-containing protein  33.82 
 
 
217 aa  121  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2405  MOSC domain-containing protein  33.82 
 
 
217 aa  121  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.458158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4279  MOSC domain-containing protein  31.39 
 
 
215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3730  MOSC domain-containing protein  35.41 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>