More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4416 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4416  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  952    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4576  Aldehyde Dehydrogenase  66.24 
 
 		 477 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0345994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2714  aldehyde dehydrogenase  66.04 
 
 		 482 aa  653    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4206  aldehyde dehydrogenase  66.03 
 
 		 477 aa  634  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2680  succinate-semialdehyde dehydrogenase  63.42 
 
 		 476 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  65.39 
 
 		 477 aa  623  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1451  aldehyde dehydrogenase  64.78 
 
 		 478 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1844  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  65.2 
 
 		 478 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1076  aldehyde dehydrogenase family protein  61.86 
 
 		 480 aa  609  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1176  aldehyde dehydrogenase  63.37 
 
 		 477 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0771902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2413  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  64.48 
 
 		 476 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.338088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2541  aldehyde dehydrogenase  63.58 
 
 		 477 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.870804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1965  aldehyde dehydrogenase  63.85 
 
 		 476 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0746  Aldehyde Dehydrogenase  63 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5533  aldehyde dehydrogenase  63.42 
 
 		 477 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  0.0235365 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0086  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  61.81 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.688678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4298  aldehyde dehydrogenase  61.18 
 
 		 481 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0727  Aldehyde Dehydrogenase  61.47 
 
 		 481 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1600  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  63.29 
 
 		 481 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397581  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3958  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  61.18 
 
 		 481 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4409  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.18 
 
 		 481 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  0.407196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5440  aldehyde dehydrogenase  61.1 
 
 		 482 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0711889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1365  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  61.68 
 
 		 479 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3830  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  61.39 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576477  normal  0.202881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4215  aldehyde dehydrogenase  62.03 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5948  aldehyde dehydrogenase  61.39 
 
 		 481 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0375443  normal  0.16852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2060  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  60.68 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.166188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2203  Aldehyde Dehydrogenase  60.68 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5717  aldehyde dehydrogenase  61.95 
 
 		 480 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0641  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  62.87 
 
 		 478 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0856  aldehyde dehydrogenase  60.76 
 
 		 479 aa  551  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3920  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  59.96 
 
 		 480 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0944  Aldehyde Dehydrogenase  60.34 
 
 		 478 aa  538  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.566077  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3961  succinate-semialdehyde dehydrogenase  54.12 
 
 		 475 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0708949  normal  0.0170918 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1026  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  60.34 
 
 		 478 aa  528  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.273416 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3638  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.07 
 
 		 475 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.344095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3197  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  55.27 
 
 		 476 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4703  Aldehyde Dehydrogenase  52.83 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.100697 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1597  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.12 
 
 		 496 aa  498  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6720  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 495 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25373  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6485  aldehyde dehydrogenase  51.26 
 
 		 485 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1053  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.53 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3739  aldehyde dehydrogenase  53.28 
 
 		 487 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4390  aldehyde dehydrogenase  50.63 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4520  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  51.37 
 
 		 477 aa  473  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0406915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0797  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.38 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3971  Aldehyde Dehydrogenase  50.32 
 
 		 477 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2116  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  51.6 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0796029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3956  Aldehyde Dehydrogenase  51.17 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3067  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.32 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3846  aldehyde dehydrogenase  50.96 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2805  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0399  aldehyde dehydrogenase family protein  47 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6819  aldehyde dehydrogenase  48.84 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.190703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0223  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  48.61 
 
 		 476 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.15 
 
 		 481 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2831  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 		 478 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.74 
 
 		 486 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1756  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.07 
 
 		 491 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.74 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.74 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.53 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  41.65 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.44 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0422  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.12 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3748  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.44 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.96 
 
 		 480 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.74 
 
 		 482 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.74 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.44 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5115  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.1 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3067  succinic semialdehyde dehydrogenase  42 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0865866  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0486  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.12 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  42.32 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.17 
 
 		 480 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6851  aldehyde dehydrogenase  44.49 
 
 		 485 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.635745  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  41.45 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  42.17 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.45 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.96 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  41.45 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  43.1 
 
 		 493 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.31 
 
 		 479 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.96 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  43.74 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.45 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0492  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  44.42 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2125  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0394  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.41264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.07 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2474  succinic semialdehyde dehydrogenase  40.77 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.353671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1820  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.61 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  43.78 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0808  succinate-semialdehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  41.4 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3676  succinate semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.851329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>