223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4352 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4352  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
594 aa  1219    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.34 
 
 
577 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.26 
 
 
577 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.66 
 
 
582 aa  320  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.87 
 
 
580 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  33.73 
 
 
578 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.36 
 
 
601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.02 
 
 
527 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.21 
 
 
515 aa  301  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  32.63 
 
 
566 aa  300  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2300  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.22 
 
 
585 aa  300  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56332  normal  0.0979902 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.31 
 
 
519 aa  296  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5631  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.72 
 
 
598 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0639  putative N-methylhydantoinase B  35.59 
 
 
558 aa  286  9e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2292  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.59 
 
 
558 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.169693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.33 
 
 
589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.43 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.28 
 
 
584 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0126981  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5965  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.39 
 
 
597 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  31.23 
 
 
640 aa  280  7e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.67 
 
 
616 aa  280  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.21 
 
 
528 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6264  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.14 
 
 
544 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3642  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.14 
 
 
557 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.31 
 
 
511 aa  273  8.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1718  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.38 
 
 
556 aa  273  9e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8174  hydantoin utilization protein  33.8 
 
 
585 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.27 
 
 
534 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7017  hydantoin utilization protein  31.48 
 
 
571 aa  270  5e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.95 
 
 
657 aa  270  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.63 
 
 
564 aa  269  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3306  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.8 
 
 
561 aa  266  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.32832  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.87 
 
 
582 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2446  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.26 
 
 
583 aa  265  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0080  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.67 
 
 
572 aa  265  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.740516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5219  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.99 
 
 
568 aa  263  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.667486  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.48 
 
 
541 aa  259  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2084  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.94 
 
 
587 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.81629  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.37 
 
 
575 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.63 
 
 
524 aa  258  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5473  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.75 
 
 
552 aa  258  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4046  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.58 
 
 
559 aa  255  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  decreased coverage  0.00136288 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4027  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.89 
 
 
558 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3956  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.15 
 
 
681 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.83 
 
 
515 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1059  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.2 
 
 
599 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.331843  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2941  5-oxoprolinase  31.99 
 
 
579 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3663  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.69 
 
 
586 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0156041 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.27 
 
 
512 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.46 
 
 
579 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5833  hydantoin utilization protein  31.43 
 
 
563 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.56 
 
 
510 aa  247  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  32.75 
 
 
574 aa  244  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3602  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.62 
 
 
597 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3732  hydantoinase B/oxoprolinase  32.37 
 
 
674 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.2 
 
 
513 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2225  5-oxoprolinase  30.87 
 
 
611 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.113832  normal  0.624978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3090  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.89 
 
 
645 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0547803  hitchhiker  0.000201646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3492  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
645 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2207  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.61 
 
 
559 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00887256  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0692  hydantoin utilization protein B  32.82 
 
 
565 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.755562  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  32.83 
 
 
537 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2414  hydantoinase B/oxoprolinase  31.93 
 
 
581 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.49373  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.65 
 
 
514 aa  232  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2646  hydantoinase B/oxoprolinase  28.96 
 
 
647 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.25 
 
 
517 aa  229  9e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  32.27 
 
 
577 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1981  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.42 
 
 
562 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307299  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2261  hydantoinase B/oxoprolinase  31.76 
 
 
581 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0175  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.25 
 
 
628 aa  227  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3514  hydantoinase B/oxoprolinase  31.57 
 
 
581 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5341  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.95 
 
 
633 aa  226  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.53 
 
 
531 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0791  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.42 
 
 
670 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.549712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.56 
 
 
539 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2859  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.12 
 
 
629 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.832595  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.26 
 
 
517 aa  222  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3648  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.37 
 
 
564 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101613  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.81 
 
 
529 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1934  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.34 
 
 
561 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1695  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.51 
 
 
632 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8487  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.24 
 
 
671 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.7 
 
 
513 aa  218  2e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1877  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.24 
 
 
613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4973  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.64 
 
 
652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.175977 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01100  hypothetical 5-oxoprolinase (Eurofung)  28.72 
 
 
1355 aa  213  7e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0381114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4084  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.17 
 
 
589 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
548 aa  213  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0123  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.45 
 
 
623 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242495  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6594  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.9 
 
 
624 aa  211  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.57 
 
 
1258 aa  210  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.33 
 
 
1213 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4825  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.17 
 
 
586 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.308896  normal  0.0497189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.64 
 
 
660 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2132  Hydantoinase B/oxoprolinase  29.3 
 
 
626 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20950  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  29.04 
 
 
647 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0800854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.43 
 
 
514 aa  208  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00009  hypothetical N-methylhydantoinase (Eurofung)  28.76 
 
 
1362 aa  207  4e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000169521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.77 
 
 
651 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13495  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  30.49 
 
 
548 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>