251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4315 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  73.86 
 
 		 461 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  73.2 
 
 		 461 aa  686    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  72.98 
 
 		 461 aa  684    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  72.65 
 
 		 463 aa  675    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  68.7 
 
 		 463 aa  655    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  100 
 
 		 462 aa  940    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  67.61 
 
 		 462 aa  623  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  59.65 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  59.91 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  57.79 
 
 		 471 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  54.7 
 
 		 463 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  56.46 
 
 		 465 aa  505  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  54.49 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  54.73 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  53.83 
 
 		 468 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  54.7 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  53.81 
 
 		 469 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  57.33 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  54.25 
 
 		 469 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  56.37 
 
 		 470 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  56.96 
 
 		 473 aa  497  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  54.25 
 
 		 469 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  53.81 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  55.63 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  53.78 
 
 		 465 aa  494  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  53.81 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  53.59 
 
 		 469 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  54.03 
 
 		 469 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  53.81 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  54.03 
 
 		 469 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  52.72 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  53.59 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  54.1 
 
 		 465 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  55.41 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  55.63 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  55.24 
 
 		 476 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  55.58 
 
 		 472 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  54.76 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  55.8 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  54.55 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  54.92 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  52.94 
 
 		 470 aa  478  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  55.36 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  54.7 
 
 		 472 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  53.38 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  49.89 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  48.26 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  51.17 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  50.22 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  51.74 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  50.76 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  52.46 
 
 		 435 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  49.89 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  50.33 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.55 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  47.71 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  47.2 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  47.82 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  47.17 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  50.33 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  45.99 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  43.83 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  48.48 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  48.25 
 
 		 458 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  48.14 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  44.85 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  42.68 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  43.25 
 
 		 470 aa  352  8e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0446  threonine synthase  42.23 
 
 		 480 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.31582  normal  0.521575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  42.37 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  42.49 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  44.14 
 
 		 483 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  42.49 
 
 		 472 aa  349  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0439  threonine synthase  42.02 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  43.04 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  42.83 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  42.83 
 
 		 475 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  44.26 
 
 		 483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  43.13 
 
 		 475 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  41.88 
 
 		 477 aa  341  1e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  43.55 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  40.2 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  43.51 
 
 		 483 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  43.31 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  41.13 
 
 		 517 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  42.68 
 
 		 475 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  41.96 
 
 		 481 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  43.24 
 
 		 483 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  43.22 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  43.22 
 
 		 476 aa  336  5.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  43.24 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  43.24 
 
 		 483 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  43.24 
 
 		 483 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1203  threonine synthase  43.01 
 
 		 481 aa  334  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.053417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>