More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4287 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  100 
 
 		 544 aa  1108    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  54.77 
 
 		 542 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  52.41 
 
 		 547 aa  555  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  53.33 
 
 		 555 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  52.04 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  51.01 
 
 		 552 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  52.99 
 
 		 545 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  52.21 
 
 		 547 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  52.67 
 
 		 547 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  50.9 
 
 		 554 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  50.92 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  49.26 
 
 		 554 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  33.51 
 
 		 624 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0099  hypothetical protein  31.16 
 
 		 577 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.119429  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  30.45 
 
 		 638 aa  217  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.17 
 
 		 584 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  30.7 
 
 		 581 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.7 
 
 		 575 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.52 
 
 		 575 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 536 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 625 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  31.83 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  28.97 
 
 		 563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 		 564 aa  183  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.95 
 
 		 537 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.37 
 
 		 604 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 650 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 601 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 586 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.86 
 
 		 601 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.88 
 
 		 583 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.24 
 
 		 585 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  27.45 
 
 		 597 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  27 
 
 		 581 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  39.24 
 
 		 525 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.86 
 
 		 648 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  30.4 
 
 		 556 aa  161  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  25.89 
 
 		 576 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  30.09 
 
 		 537 aa  153  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.27 
 
 		 592 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.81 
 
 		 539 aa  151  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 530 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.73 
 
 		 542 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 606 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2885  amidohydrolase 3  29.89 
 
 		 569 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00571861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  29.54 
 
 		 590 aa  141  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.86 
 
 		 543 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.22 
 
 		 574 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.63 
 
 		 539 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 541 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 543 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.08 
 
 		 549 aa  136  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.79 
 
 		 603 aa  136  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.48 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 		 543 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 583 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 583 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 553 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.98 
 
 		 505 aa  133  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 620 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1737  Amidohydrolase 3  25.09 
 
 		 618 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.79 
 
 		 549 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 546 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.38 
 
 		 537 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3625  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.92 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.27 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.27 
 
 		 543 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  25.56 
 
 		 522 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.34 
 
 		 527 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  27.52 
 
 		 541 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 550 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  27 
 
 		 550 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.94 
 
 		 520 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  36.36 
 
 		 548 aa  123  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  23.55 
 
 		 526 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  29.59 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4231  Amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 626 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  29.29 
 
 		 544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.26 
 
 		 616 aa  120  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.01 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.96 
 
 		 544 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.45 
 
 		 583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  35.48 
 
 		 548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22680  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  30.07 
 
 		 535 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  28.07 
 
 		 560 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  30.09 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  29.21 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>