More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4208 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  100 
 
 		 367 aa  732    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  50.28 
 
 		 372 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  49.72 
 
 		 372 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  44.53 
 
 		 402 aa  317  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  45.15 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  44.39 
 
 		 398 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  44.13 
 
 		 405 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  46.09 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  45.66 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  45.64 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  43.18 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  43.65 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  45.36 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  43.11 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  43.99 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  43.81 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  45.31 
 
 		 382 aa  285  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  47.44 
 
 		 390 aa  286  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  44.78 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  43.22 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  44.72 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  46.97 
 
 		 1228 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  43.73 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  46.84 
 
 		 1230 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  43.32 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  42.86 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  46.74 
 
 		 389 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  45.36 
 
 		 401 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  41.9 
 
 		 411 aa  279  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  50.29 
 
 		 402 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  43.41 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  43.41 
 
 		 392 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  44.05 
 
 		 1305 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  45.75 
 
 		 1230 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  43.15 
 
 		 392 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  43.15 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  43.15 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  43.15 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  41.03 
 
 		 394 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  42.12 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  40.89 
 
 		 393 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  42.24 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  44.64 
 
 		 400 aa  270  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  41.79 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  40.82 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  44.99 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  45.14 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  44.56 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  41.71 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  45.09 
 
 		 398 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  44.22 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  39.6 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  41.12 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  43.65 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  43.79 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  50.29 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  50.29 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  39.9 
 
 		 403 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  36.84 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  46.47 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  40.36 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  39.58 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  42.29 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  39.85 
 
 		 397 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  42.29 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  43.37 
 
 		 392 aa  252  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  47.7 
 
 		 385 aa  252  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  44.84 
 
 		 371 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  38.14 
 
 		 399 aa  249  4e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  43.88 
 
 		 400 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  38.6 
 
 		 414 aa  249  6e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  39.55 
 
 		 397 aa  248  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  41.45 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  36.66 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  40.31 
 
 		 412 aa  245  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  36.25 
 
 		 396 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  40.56 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  42.12 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  35 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  38.44 
 
 		 398 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  38.64 
 
 		 408 aa  242  9e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  41.21 
 
 		 395 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  34.08 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  36.92 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.57 
 
 		 404 aa  240  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  42.61 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  40.2 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  35.5 
 
 		 401 aa  239  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  32.33 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  40.2 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  40.25 
 
 		 415 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  34 
 
 		 397 aa  239  8e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  43.58 
 
 		 407 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  37.91 
 
 		 414 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  34.43 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  42.9 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  39.53 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  42.33 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  41.76 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  33.42 
 
 		 397 aa  235  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>