84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4115 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4115  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2595  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.73 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3266  putative metallothiol transferase  71.77 
 
 		 126 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3893  glyoxalase, putative  70.16 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222146  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1693  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1665  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.92 
 
 		 130 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0767303  normal  0.10787 
 
 
-
 
NC_003296  RS03174  hypothetical protein  70.16 
 
 		 126 aa  176  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1601  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.8 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68.8 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0844226  normal  0.672862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  66.67 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 		 127 aa  173  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.111375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  68 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0294126 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4038  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.24 
 
 		 130 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.23 
 
 		 125 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2987  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.7 
 
 		 128 aa  159  8.000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.9 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  62.4 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  62.6 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.1 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1322  hypothetical protein  55.28 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.84 
 
 		 125 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.74 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.85 
 
 		 141 aa  148  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.92 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.92 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  54.92 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.14 
 
 		 134 aa  143  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.92 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.1 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.1 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.1 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.1 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  54.4 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  54.4 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2351  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  52.89 
 
 		 132 aa  130  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  52.07 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.07 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.1 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  50 
 
 		 126 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1528  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.07 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  52.07 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.82 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.26 
 
 		 126 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0851141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.9 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2211  30S ribosomal protein S15  41.41 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  41.41 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1815  putative ring-cleaving dioxygenase  47.25 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.35 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.02 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.13 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.85 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7861  hypothetical protein  40.77 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433206 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  40.34 
 
 		 130 aa  84.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003185  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003189  hypothetical protein  42.11 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003199  hypothetical protein  43.16 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02088  hypothetical protein  54.93 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.66 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.19 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.34 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3833  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.68 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1729  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.58 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.43 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751466  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  30.95 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.16 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02089  hypothetical protein  55.56 
 
 		 44 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3146  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.26 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000000451164  unclonable  0.00000000000414135 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3172  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657624  decreased coverage  0.000000082582 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000010528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6509  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.6 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000178969  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3090  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.82 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000152154  decreased coverage  0.00078643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.54 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3206  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000404623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0011  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.708628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0978  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.46 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00125904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2788  glyoxalase/dioxygenase superfamily protein  29.41 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>