More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4102 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3800  50S ribosomal protein L27  83.33 
 
 		 89 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3820  50S ribosomal protein L27  81.11 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1201  50S ribosomal protein L27  81.11 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.862516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3512  50S ribosomal protein L27  81.11 
 
 		 89 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2281  50S ribosomal protein L27  75.56 
 
 		 89 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.350544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1461  50S ribosomal protein L27  75.56 
 
 		 89 aa  143  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0317862 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  73.33 
 
 		 90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0154  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 90 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0588  50S ribosomal protein L27  70 
 
 		 90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0152  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.670785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  70.33 
 
 		 91 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 89 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  72.29 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0440  50S ribosomal protein L27  67.78 
 
 		 90 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.944777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0515  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 90 aa  127  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  69.15 
 
 		 93 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0247  50S ribosomal protein L27  68.89 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2785  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0242571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3188  50S ribosomal protein L27  68.54 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.263255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  67.78 
 
 		 89 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  71.59 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 93 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0930  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 89 aa  123  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 92 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  72.94 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1241  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572861  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  123  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2042  50S ribosomal protein L27  71.11 
 
 		 89 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.20995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0232  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  121  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  70.59 
 
 		 87 aa  120  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 87 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  69.41 
 
 		 86 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0426  50S ribosomal protein L27  65.56 
 
 		 89 aa  116  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 100 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 85 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0870  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  114  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000545576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0955  50S ribosomal protein L27  69.51 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.455715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0559  50S ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00191418  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1304  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2522  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.587643  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3523  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3525  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.986116  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  113  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3489  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1141  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  61.36 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0445  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3259  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1682  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000249957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0497  50S ribosomal protein L27  61.54 
 
 		 90 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000367607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0853  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0896  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3124  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000107863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3640  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0794  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000203934  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  68.29 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  65.85 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0798  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0702  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.616074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>